GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手
通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的 … Continue reading
通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的 … Continue reading
TCGA的28篇教程往期目录如下: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据 ( … Continue reading
看起来只是一个摘要,并没有相关文章出来: http://ascopubs.org … Continue reading
it’s extremly easy to use firehose_get t … Continue reading
TCGA CNV全攻略 明白什么是CNV 对正常人来说,基因组应该是二倍体的,所 … Continue reading
下载TCGA所有癌症的maf文件做signature分析 sanger研究所已经 … Continue reading
TCGA计划的4个找somatic mutation的软件使用体验 体细胞突变( … Continue reading
下载TCGA所有癌症的maf文件计算TMB 明白什么是TMB TMB (Tumo … Continue reading
很多人总是问我如何挖掘TCGA的数据,发文章! 可是他却连TCGA的数据是怎么来 … Continue reading
这个不出图,会给出TCGA里面涉及到的所有基因跟你指定的基因的表达量相关系数和P … Continue reading
上面是指定一个基因在不同的癌种里面,本次讲指定任意两个基因,在所有癌种里面找到c … Continue reading
好像文章题目没有长度限制,太好了!本讲所实现的目标非常简单,如题,指定基因在不同 … Continue reading
这个TCGA表达数据的多项应用系列帖子是应群里朋友的要求来写的,你们也可以继续提 … Continue reading
这是TCGA数据挖掘系列文章之一,是安德森癌症研究中心的Han Liang主导的 … Continue reading
这是TCGA数据挖掘系列文章之一,是安德森癌症研究中心的Han Liang主导的 … Continue reading
如果你研究癌症,那么TCGA计划的如此丰富的公共数据你肯定不能错过,一般人只能获 … Continue reading
再次强调一下,R里面实现生存分析非常简单! 用my.surv <- sur … Continue reading
我们知道了生存分析,就是随着时间的流逝,死亡率是如何增加的,一般是用KM法来估计 … Continue reading
该软件是broad institute写的一个数据接口,主要是供他人下载TCGA … Continue reading
无意中看一篇文献,有提到这个数据集,我简单看了一下,居然还真的这么全面!!! 它 … Continue reading