十二 13

可怕的中国教育(转)

无意中看到这篇文章,感觉挺有趣的!
我不知道国外的教育是咋样的,但是文中描述的中国教育的试题都是千真万确的,我也经历过。
我没看过有钱人家的小孩,不知道那些花了几百万买个几平米的学区房的那些人的小孩是不是也要经受这样的教育摧残?
我还有个问题,我是如何出淤泥而不染的呢?
随便瞎扯,大家自己看这篇文章吧!
可怕的中国教育,聪明伶俐进去呆若木鸡出来
       作者:葛小琴
  来源:杂文月刊(文摘版)
  侄子在读高二,考了一道历史题:成吉思汗的继承人窝阔台,公元哪一年死?最远打到哪里?答不出来,我帮他查找资料,所以到现在我都记得,是打到现在的匈牙利附近。
  在一次偶然的机会,我发现美国世界史这道题目不是这样考的。它的题目是这样的:成吉思汗的继承人窝阔台,当初如果没有死,欧洲会发生什么变化?试从经济、政治、社会三方面分析。
   有个学生是这样回答的:这位蒙古领导人如果当初没有死,那么可怕的黑死病,就不会被带到欧洲去,后来才知道那个东西是老鼠身上的跳蚤引起的鼠疫。但是六 百多年前,黑死病在欧洲猖獗的时候,谁晓得这个叫做鼠疫?如果没有黑死病,神父跟修女就不会死亡。神父跟修女如果没有死亡,就不会怀疑上帝的存在。如果没 有怀疑上帝的存在,就不会有意大利弗罗伦斯的文艺复兴?
  如果没有文艺复兴,西班牙、南欧就不会强大,西班牙无敌舰队就不可能建立。如果西班牙、意大利不够强大,盎格鲁—撒克逊会提早200年强大,日耳曼会控制中欧,奥匈帝国就不可能存在。
  教师一看“棒,分析得好。”但他们没有分数,只有等级A。其实这种题目老师是没有标准答案的,可是大家都要思考。
  不久前,我去了趟日本,日本总是和我们在历史问题上产生纠葛,所以我在日本很注意高中生的教科书。
   他们的教师给高中生布置了这样一道题:日本跟中国100年打一次仗,19世纪打了日清战争(即甲午战争),20世纪打了一场日中战争(即抗日战 争),21世纪如果日本跟中国开火,你认为大概是什么时候?可能的远因和近因在哪里?如果日本赢了,是赢在什么地方?输了是输在什么条件上?分析之。
   其中有个高中生是这样分析的:我们跟中国很可能在台湾回到中国以后,有一场激战。台湾如果回到中国,中国会把基隆与高雄封锁,台湾海峡就会变成中国的内 海,我们的油轮就统统走右边,走基隆和高雄的右边。这样,会增加日本的运油成本。我们的石油从波斯湾出来跨过印度洋,穿过马六甲海峡,上中国南海,跨台湾 海峡进东海到日本海,这是石油生命线,中国政府如果把台湾海峡封锁起来,我们的货轮一定要从那里经过,我们的主力舰和驱逐舰就会出动,中国海军一看到日本 出兵,马上就会上场,就开打。
  按照判断,公元2015年至2020年之间,这场战争可能爆发。所以,我们现在就要做对华抗战的准备。
  我看其他学生的判断,也都是中国跟日本的摩擦会从东海从台湾海峡开始,时间判断是2015年至2020年之间。
  这种题目和答案都太可怕了。
   撇开政治因素来看这道题,我们的历史教育就很有问题。翻开我们的教科书,题目是这样出的:甲午战争是哪一年爆发的?签订的叫什么条约?割让多少土地?赔 偿多少银两?每个学生都努力做答案。结果我们一天到晚研究什么时候割让辽东半岛,什么时候丢了台湾、澎湖、赔偿二万银两,1894年爆发甲午战争、 1895年签订马关条约,背得滚瓜烂熟,都是一大堆枯燥无味的数字。
  那又怎么样,反正都赔了嘛,银两都给了嘛,最主要的是将来可能会怎样。
  人家是在培养能力,而我们是在灌输知识,这是值得深思的部分!
  看外面的教育,再看我们的教育?
  老妈去参加我侄子的家长会,带回了两套侄子的考试试卷,我很好奇,拿过来看了现在小学生的试卷后,我震惊了!这是什么狗屁教育?这样的教育有希望吗?下面给大家详细说说我看到了什么。
  侄子在本市某著名小学读书,有这么几道题。
  一个春天的夜晚,一个久别家乡的人,望着皎洁的月光不禁思念起了故乡,于是吟起了一首诗:( ),( )。
   我看到侄子答的是:举头望明月,低头思故乡。但后面是一把大大的×,我就奇怪了,我也是想到的这两句。好奇地问侄子,这个不对??那答案是什么?侄子说 标准答案是:春风又绿江南岸,明月何时照我还。哎,这就奇怪了,因为是个春天的夜晚,就要是这句有春风的???要这个思念故乡的人不是江南的,是不可能说 出春风又绿江南岸这句话的!!!举头望明月,低头思故乡应该更准确。再扯远点,思念故乡,一千个人可以吟一千句不一样的诗,这个也可以有标准答案的么?
  接下来是默写,题目是:我们学过《桂林山水》一文,请将下面句子默写下来。然后就是整段的要默写,这有什么用?死记硬背别人的文字有什么用?
   还有个题目,《匆匆》这篇课文,是现代着名作家朱自清先生写的,同学们都很喜欢这篇散文,你能把自己最喜欢,印象最深刻的一句写下来吗?我侄子写的是: 我的日子滴在时间的流里,没有声音,也没有影子。后面一把好大的×。标准答案竟然是:但是,聪明的你告诉我,我们的日子为什么一去不复返呢?这就更奇怪 了,一篇文章,你可以喜欢这句,我可以喜欢那句,难道最喜欢的一句话也要统一么?为什么“我的日子滴在时间的流里,没有声音,也没有影子。”这句不能喜 欢?就一定要喜欢“但是,聪明的你告诉我,我们的日子为什么一去不复返呢?”这句?我觉得这个题目应该是“你能把老师最喜欢,印象最深刻的一句写下来 吗?”才对!
  再看别的试卷,更莫名其妙了,比如请说出阿拉伯数字的来历,是哪个国家创造的?侄子不知道,问我,我也不知道。我只好去搜一下,才知道是古印度人发明的。莫非我吃块猪肉,还一定得知道它是哪个养猪场养出来的?
   最后有个题目让我彻底崩溃了:请用一句话说明π的含义。侄子回答π的含义是圆周率。竟然打的是×,这就奇怪了,正好我老婆大学说读的是理科,我马上问 她,π是什么意思,她说圆周率啊。两个人狂汗,问了侄子半天,标准答案大概是,π是一个在数学及物理学领域普遍存在的数学常数……
  如果你也觉得这种教育很无耻,就请转发吧,让更多的人来参与呼吁改变,为了孩子为了国家的未来 …… 别让孩子聪明伶俐地进去呆若木鸡地出来!
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转-windows快捷键,让你的办公效率提升一个档次

  1. gpedit.msc-----组策略

2. sndrec32-------录音机

3. Nslookup-------IP地址侦测器

4. explorer-------打开资源管理器

5. logoff---------注销命令

6. tsshutdn-------60秒倒计时关机命令

7. lusrmgr.msc----本机用户和组

8. services.msc---本地服务设置

9. oobe/msoobe /a----检查XP是否激活

10. notepad--------打开记事本

11. cleanmgr-------垃圾整理

12. net start messenger----开始信使服务

13. compmgmt.msc---计算机管理

15. conf-----------启动netmeeting

16. dvdplay--------DVD播放器

17. charmap--------启动字符映射表

18. diskmgmt.msc---磁盘管理实用程序

 19. calc-----------启动计算器

20. dfrg.msc-------磁盘碎片整理程序

21. chkdsk.exe-----Chkdsk磁盘检查

22. devmgmt.msc--- 设备管理器

23. regsvr32 /u *.dll----停止dll文件运行

24. drwtsn32------ 系统医生

25. rononce -p ----15秒关机

26. dxdiag---------检查DirectX信息

27. regedt32-------注册表编辑器

28. Msconfig.exe---系统配置实用程序

29. rsop.msc-------组策略结果集

30. mem.exe--------显示内存使用情况

31. regedit.exe----注册表

32. winchat--------XP自带局域网聊天

33. progman--------程序管理器

34. winmsd---------系统信息

  43. write----------写字板

44. winmsd---------系统信息

46. winchat--------XP自带局域网聊天

48. Msconfig.exe---系统配置实用程序

49. mplayer2-------简易widnows media player

50. mspaint--------画图板

51. mstsc----------远程桌面连接

52. mplayer2-------媒体播放机

53. magnify--------放大镜实用程序

 54. mmc------------打开控制台

55. mobsync--------同步命令

56. dxdiag---------检查DirectX信息

57. drwtsn32------ 系统医生

58. devmgmt.msc--- 设备管理器

59. dfrg.msc-------磁盘碎片整理程序

60. diskmgmt.msc---磁盘管理实用程序

61. dcomcnfg-------打开系统组件服务

62. ddeshare-------打开DDE共享设置

65. net start messenger----开始信使服务

67. nslookup-------网络管理的工具向导

68. ntbackup-------系统备份和还原

69. narrator-------屏幕“讲述人”

70. ntmsmgr.msc----移动存储管理器

71. ntmsoprq.msc---移动存储管理员操作请求

72. netstat -an----(TC)命令检查接口

73. syncapp--------创建一个公文包

  74. sysedit--------系统配置编辑器

75. sigverif-------文件签名验证程序

76. sndrec32-------录音机

77. shrpubw--------创建共享文件夹

78. secpol.msc-----本地安全策略

 80. services.msc---本地服务设置

81. Sndvol32-------音量控制程序

82. sfc.exe--------系统文件检查器

83. sfc /scannow---windows文件保护

84. tsshutdn-------60秒倒计时关机命令

85. tourstart------xp简介(安装完成后出现的漫游xp程序)

86. taskmgr--------任务管理器

 87. eventvwr-------事件查看器

88. eudcedit-------造字程序

 92. progman--------程序管理器

94. rsop.msc-------组策略结果集

95. regedt32-------注册表编辑器

96. rononce -p ----15秒关机

99. cmd.exe--------CMD命令提示符

100. chkdsk.exe-----Chkdsk磁盘检查

101. certmgr.msc----证书管理实用程序

 102. calc-----------启动计算器

103. charmap--------启动字符映射表

104. cliconfg-------SQL SERVER 客户端网络实用程序

105. Clipbrd--------剪贴板查看器

106. conf-----------启动netmeeting

107. compmgmt.msc---计算机管理

108. cleanmgr-------垃圾整理

109. ciadv.msc------索引服务程序

110. osk------------打开屏幕键盘

 113. lusrmgr.msc----本机用户和组

114. logoff---------注销命令

115. fsmgmt.msc-----共享文件夹管理器

116. utilman--------辅助工具管理器

117. iexpress-------木马捆绑工具

 打开服务管理器的是services.msc

如果要用cmd直接启用已知服务名的服务如下:

net start [服务名] 启动一个服务

net stop [服务名] 停用一个服务

 

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转载-VCF格式详解

CHROM(chromosome):染色体

POS - position:参考基因组variant碱基位置,如果是INDEL(插入缺失),位置是INDEL的第一个碱基位置

ID - identifier: variant的ID。比如在dbSNP中有该SNP的id,则会在此行给出;若没有,则用’.'表示其为一个novel variant。

REF - reference base(s):参考碱基,染色体上面的碱基,必须是ATCGN中的一个,N表示不确定碱基

ALT - alternate base(s):与参考序列比较发生突变的碱基

QUAL - quality: Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该位点存在variant的可能性;该值越高,则variant的可能性越大;计算方法:Phred值 = -10 * log (1-p) p为variant存在的概率; 通过计算公式可以看出值为10的表示错误概率为0.1,该位点为variant的概率为90%。

FILTER - _filter status: 使用上一个QUAL值来进行过滤的话,是不够的。GATK能使用其它的方法来进行过滤,过滤结果中通过则该值为”PASS”;若variant不可靠,则该项不为”PASS”或”.”。

INFO - additional information:  这一行是variant的详细信息,具体如下:

DP-read depth:样本在这个位置的reads覆盖度。是一些reads被过滤掉后的覆盖度。          DP4:高质量测序碱基,位于REF或者ALT前后

MQ:表示覆盖序列质量的均方值RMS Mapping Quality

FQphred值关于所有样本相似的可能性

AF1 AF(Allele Frequency) 表示Allele的频率,AF1为第一个ALT allele 发生频率的可能性评估

AC1AC表示Allele(等位基因)的数目,AC1为对第一个ALT allele count的最大可能性评估

AN:AN(Allele Number) 表示Allele的总数目

IS插入缺失或部分插入缺失的reads允许的最大数量

ACAC(Allele Count) 表示该Allele的数目

G3ML 评估基因型出现的频率

HWE:chi^2基于HWE的测试p值和G3

CLR在受到或者不受限制的情况下基因型出现可能性log值

UGT:最可能不受限制的三种基因型结构

CGT:最可能受限制三种基因型的结构

PV4四种P值得误差,分别是(strand、baseQ、mapQ、tail distance bias)

INDEL:表示该位置的变异是插入缺失

PC2非参考等位基因的phred(变异的可能性)值在两个分组中大小不同

PCHI2后加权chi^2,根据p值来测试两组样本之间的联系

QCHI2:Phred scaled PCHI2.

PR置换产生的一个较小的PCHI2

QBD:Quality by Depth,测序深度对质量的影响

RPB序列的误差位置(Read Position Bias)

MDV:样本中高质量非参考序列的最大数目

VDB:Variant Distance Bias,RNA序列中过滤人工拼接序列的变异误差范围

GT样品的基因型(genotype)。两个数字中间用’/'分 开,这两个数字表示双倍体的sample的基因型。0 表示样品中有ref的allele; 1 表示样品中variant的allele; 2表示有第二个variant的allele。因此: 0/0 表示sample中该位点为纯合的,和ref一致; 0/1 表示sample中该位点为杂合的,有ref和variant两个基因型; 1/1 表示sample中该位点为纯合的,和variant一致。

GQ基因型的质量值(Genotype Quality)。Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表示在该位点该基因型存在的可能性;该值越高,则Genotype的可能性越 大;计算方法:Phred值 = -10 * log (1-p) p为基因型存在的概率。

GL三种基因型(RR RA AA)出现的可能性,R表示参考碱基,A表示变异碱基

DV高质量的非参考碱基

SPphred的p值误差线

PL:指定的三种基因型的质量值(provieds the likelihoods of the given genotypes)。这三种指定的基因型为(0/0,0/1,1/1),这三种基因型的概率总和为1。和之前不一致,该值越大,表明为该种基因型的可能 性越小。 Phred值 = -10 * log (p) p为基因型存在的概率。

FORMAT BC1-1-base.sorted.bam这两行合起来提供了’ BC1-1-base′这个sample的基因型的信息。’ BC1-1-base′代表这该名称的样品,是由BAM文件中的@RG下的 SM 标签决定的。

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转-基因突变种类大全

突变(Mutation, 即基因突变):在生物学上的含义,是指细胞中的遗传基因(通常指存在于细胞核中的脱氧核糖核酸)发生的改变。它包括单个碱基改变所引起的点突变,或多个碱基的缺失、重复和插入。原因可以是细胞分裂时遗传基因的复制发生错误、或受化学物质、辐射或病毒的影响。

以功能分类:

失去功能的突变Loss-of-function mutations

失去功能的突变是指发生的突变会造成基因完全地失去活性,原因可分成两类。一类是由于基因被删除或是调控基因表现的过程受到影响让基因不表现,另一种则是由于基因本身受到影响,使得基因的产物蛋白质失去功能。又称剔除突变null mutations)或是敲除突变knockout mutations)。

次形态突变Time form mutation此种突变会使基因的表现或是基因产物的活性减弱,但不会消失。

超形态突变hypermorphic mutations此种突变与次形态突变相反,会使基因的表现加强

获得功能的突变gain-of-function mutation获得功能的突变是指发生的突变让原本应该是不表现的基因产生活性,进而影响细胞功能,这样的突变多半需要染色体程度的突变较有可能产生,而最常发生获得功能的突变就是癌细胞。

以突变机理分类:

  1. 点突变point mutation:DNA序列中涉及单个核苷酸或碱基的变化称为点突变。 通常有两种情况:一是一种碱基或核苷酸被另一种碱基或核苷酸所替换;二是一个碱基的插入缺失。

                   (1)沉默突变silent mutation

当点突变发生在基因及其调控序列之外,或使基因序列内一种密码子变成编码同一种氨基酸的另一种同义密码子时,不会改变生物个体的基因产物,因而不引起性状变异。不引起生物性状变异的突变称为沉默突变。

                   (2)错义突变missense mutation

指由于某个碱基对的改变,使编码一种氨基酸的密码子变成编码另外一种氨基酸的密码子,结果使构成蛋白质的数百上千个氨基酸中有一个氨基酸发生变化。(实例:镰刀形细胞贫血症

                   (3)移码突变frameshift mutation

指在DNA链上,有时一个或几个非3的整数倍的碱基的插入或缺失,往往产生比碱基替换突变更严重的后果。 这种插入或缺失突变会造成阅读框的改变,翻译过程中其下游的三联密码子都被错读,产生完全错误的肽链或肽链合成提前终止。这种插入或缺失突变又称为移码突变。

                   (4)无义突变nonsense mutation

是指当点突变使一个编码氨基酸的密码子变成终止子时,则蛋白质合成进行到该突变位点时会提前终止,结果产生一个较短的多肽链或较小的蛋白质。

  1. 大突变

大突变是可能涉及整个基因以至多个基因的一长段DNA序列的改变,大突变常常导致染色体畸变。

(1)缺失:指DNA分子丢失一段碱基序列。(染色体缺失)(Deletion)

(2)插入:指DNA分子的正常序列中插入一段DNA序列。(Insertion②)

(3)重排:重排包括某段DNA序列的重复(duplication),倒位(inversion),易位(translocation)等。

 

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转-R语言内存管理

R中的对象(比如矩阵)在内存中存于两种不同的地方:

第一种是堆内存(heap),其基本单元是“Vcells”,每个大小为8字节,新来一个对象就会申请一块空间,把值全部存在这里,和C里面的堆内存很像;

第二种是地址对(cons cells),主要用来存储地址信息,最小单元一般在32位系统中是28字节、64位系统中是56字节。

1、ls()来查看当前所有对象名,对于每一个对象,可以通过object.size(x)来查看其占用内存的大小。

如果是因为当前对象占用内存过多,那么可以通过处理对象来获取更大的可用内存。一个很有用的方法是改变对象的存储模式,通过storage.mode(x)可以看到某个对象的存储模式,比如某个矩阵默认就是“double”的,如果这个矩阵的数值都是整数甚至0-1,完全没必要使用double来占用空间,可以使用storage.mode(x) <- "integer"将其改为整数型,可以看到该对象的大小会变为原来的一半。

2、object.size()看每个变量占多大内存。

3、memory.size()查看现在的work space的内存使用

4memory.limit()查看系统规定的内存使用上限。如果现在的内存上限不够用,可以通过memory.limit(newLimit)更改到一个新的上限。注意,在32位的R中,封顶上限为4G,无法在一个程序上使用超过4G (数位上限)。这种时候,可以考虑使用64位的版本。

 

对于一些很大的但无用的中间变量,养成清理的习惯:

可以使用rm(object)删除变量,但是记住,rm后记得使用gc()做Garbage collection,否则内存是不会自动释放的,相当于你没做rm.