08

逆向收费读文献社群

刻意练习,10万小时定律,相信大家都有所了解。

我们生信技能树平台最近开始做生物信息学入门培训,感触良多,虽然大家相比我入门摸索生信的姿势来说是幸运很多,但对真正的科研来说,仍然不够,科研不是简单的分析一套数据拿到变异位点,或者差异基因,进行注释即可,而是要完整的讲好一个故事。而一个生物学故事是由背景知识+前人工作总结+方法+自己的结果+展望组成,大量的已经完成的好的故事值得我们学习和借鉴。 Continue reading

05

新的致癌基因KLHL22

一个月前朋友刚刚推荐了2018的nature The protein histidine phosphatase LHPP is a tumour suppressor 阐述了一个新的抑癌基因LHPP,今天又有朋友推荐了一个新的致癌基因KLHL22 ,文章是:KLHL22 activates amino-acid-dependent mTORC1 signalling to promote tumorigenesis and ageing.

在PubMed查询:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=KLHL22

https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=KLHL22 Continue reading

30

counts2rpkm

为什么要做这个计算

大家都知道在真核生物里面,一个基因有多个转录本,每个转录组又是由不同的外显子组合而成,以前老旧的RNA-seq分析流程比较喜欢用RPKM值来量化表达量。大家很容易可以搜索到RPKM的公式,里面考虑到了基因长度。 Continue reading