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TCGA数据里面的生存分析例子

我们知道了生存分析,就是随着时间的流逝,死亡率是如何增加的,一般是用KM法来估计生存函数,然后画个图即可!而根据某些因子把样本分组,可以看到他们死亡率的变化趋势显著的不同,这就说明了我们的这个因子是非常有效的分类方式,这个因子可以是一个biomarker,也可以某些其它指标!
甚至,我们还可以用cox模型来分析这个因子是如何影响生存函数的,那个稍后再讲
这里,我们就简单讲一个例子,是TCGA里面卵巢癌的数据,根据甲基化数据分成了4个组,那么我们就下载这四个组样本的临床数据,
看看这样分组后,他们的死亡率变化趋势是不是有显著区别!

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