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2016-TCGA数据挖掘系列文章之癌症男女有别

这是TCGA数据挖掘系列文章之一,是安德森癌症研究中心的Han Liang主导的,纯粹的生物信息学数据分析文章。
文章题目是:comprehensive characterization of molecular differences in cancer between male and female patients.
研究意义:癌症病人的性别对肿瘤发生,扩散的意义不言而喻。不仅仅是因为很多癌症本来就是有性别特异性,比如卵巢癌之于女性、前列腺癌之于男性。即使对于其它并非性别特异性的癌症种类,男女病人在肿瘤发生,扩散,以及治疗阶段的反应也大不一样。但是以前对这样分子机理研究的很有限,一般集中在某些性别相关的分子pattern,比如非小细胞肺癌女性患者的EGFR突变,但那些研究要么就局限于单一的基因,要么局限于单一的数据类型,或者研究单一的癌症。严重缺乏一个全面的,系统的分析癌症患者的性别差异。而且TCGA数据库的出现让这一个研究变成了可能,这也就是本文章的出现的原因。
数据挖掘的对象:
如表所示,涉及到13种癌症,TCGA的六种数据()都用上了,因为是2016年,所以数据量也比较全面了。

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