咱们搞生物信息学数据分析的小伙伴通常是接触过服务器，但是呢，很少是物理空间的接触，我们的测序数据上传到服务器通常是使用ftp软件，比如工具FileZilla 和winscp这样的，或者使用scp命令。绝大部分情况下没有问题，怕的就是自己电脑跟服务器的通讯网络太差，而且有时候端口也不一定是22或者21。 Continue reading →

最近学习班的小伙伴跟着我们《生信技能树》的入门课程开始学习R语言了，其中一个小伙伴做课前准备工作的时候出现了一个“无伤大雅”的问题： Continue reading →

介绍

备份了GEO数据库里面的几乎全部的表达量芯片数据集的表达量矩阵和临床信息矩阵 Continue reading →

咱们《生信技能树》的学徒兴冲冲的发给我了一份学习资料，希望我推荐给大家。我浏览了一下，确实不错，值得广而告之。 Continue reading →

本来呢，这应该是一个教程，但最近是过年休假期间，我也不能无限制的回答粉丝提问，所以借《生信技能树》的便利给他发一个有偿求图的的宣传： Continue reading →

我太喜欢微信公众号的专辑这个功能了，帮我把2020在《生信技能树》公众号发布的300多篇生物信息学笔记很方便的串联起来了。但蓦然回首，赫然发现这个2020我居然真的并没有学习什么新知识，但是不管怎么说，坚持下来了，就还不差了。做生物信息学笔记分享的这七年，见过了太多优秀的公众号销声敛迹，能活着就值得敬佩！ Continue reading →

终于等到你，还好我没放弃！
了解咱们《生信技能树》的朋友都应该是了解，对99.9%的粉丝来说，我们其实是没有商业服务能提给你的。大家能看到的仅仅是我们非常有限度的招聘推广，加上一些公司测序产品推广，再就是我们自己的学习班和服务器啦： Continue reading →

大庇天下寒士俱欢颜！
基础配置：96核心384G内存的超级服务器(共享)使用权一年（年付费600元人民币即可），每个人独立磁盘空间200~300G。（硬盘可根据需求付费增加） Continue reading →

众所周知，StatQuest生物统计学视频是一个很优秀的生物统计学系列教程，教程作者是Josh Starmer （个人博客https://statquest.org/），生信菜鸟团很早之前就推过相关的学习资源。见： Continue reading →

我注意到3个月的一个学员超级优秀，把我们的一个月授课内容系统性的整理成为了200篇左右的学习笔记，创立了一个公众号，精选目录如下： Continue reading →

前些天我们在《生信技能树》和《生信菜鸟团》同步宣传了：Linux公益课2021，对广大粉丝来说确实是好事。不过有极少数粉丝表示自己并没有Linux服务器，所以呢，很难跟上我们的课程，这个就有点尴尬。 Continue reading →

最近有粉丝来信表示我的免费视频课程《LncRNA-seq数据》非常的“简陋”，就是在用一个lncRNA芯片和一个lncRNA测序的数据来演示如何获得表达矩阵，以及后续的各种图表代码操作。完全没有生物学背景，并不是一个系统的课程，仅仅是技能展现。 Continue reading →

前面介绍了R的统计函数，有好多小伙伴通过留言反馈，说对R语言的数据结构还不是很清楚，今天我们就聊一下R中关于数据那点事。 Continue reading →

Continue reading →

通常我们拿到一个全新服务器，要给大家使用，需要配置最新版R环境，代码如下： Continue reading →

怕什么报错呢，重来一次不就好了吗！

学员群有人提问，他们上完了我们的转录组课程，自己拿服务器去跑一个文献数据，有一个样本的sam转为bam文件报错，得到文件如下: Continue reading →

学徒在完成转录组实战任务的时候，出现了一个小bug，自顾自的纠结了一晚上不过来寻求我的帮助。让我非常生气，因为确实是很简单的两个小技巧，主要是理解全局变量、环境变量。 Continue reading →

看到朋友圈小伙伴转发了一个有味道的研究：
研究者们收集了 12个中国成年人的尿液，we performed scRNA-seq on voided urine samples. 50–100 mL middle stream urine samples were collected from 12 Chinese healthy adults and combined for droplet-based single-cell RNA sequencing after flow cytometric sorting of live cells. Continue reading →

我看到2020年10月发表在cancer cell杂志的文章《Senescence Reprogramming by TIMP1 Deficiency Promotes Prostate Cancer Metastasis》，链接是：https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.10.012 ， Continue reading →

三年多没有看我们《生信技能树》的论坛了，都差点忘记了这个产品，昨天不小心点击进去了，恰好看到了一个问题，就回复一下吧！ Continue reading →