最近升级了R，全部R包需要批量安装，所以有了昨天的教程：批量安装R包小技巧大放送 但是总会有一些R包安装失败，比如大名鼎鼎的WGCNA Continue reading
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Daily Archives: 2020年2月19日
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乳腺癌单细胞水平的病理特征研究
2013年，“单细胞测序”被nature杂志选为“年度技术”，以突出这项技术可以对单个细胞进行DNA和RNA测序，进而让科学家能够推断不同细胞的生物学差异。从此单细胞测序飞速发展，扩大了我们对细胞异质性及其对细胞功能的影响的认识，我们单细胞天地也是这两年集中火力系统性整理了大量单细胞数据分析经验。 Continue reading
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生物信息学数据分析免费做活动大扩散
欢迎所有生信技能树、生信菜鸟团的朋友分享这个生物信息学数据分析免费做活动，让你提前体验到数据分析的魅力，希望这样，你能完成我 2020学习主旋律，B站74小时免费教学视频为你领路 的学习，给你一些动力！ Continue reading
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生信技能树的2019年终总结
节日的气氛不适合静下心来学习，追求完美的后果就是无限拖延，感谢公众号的机制是每日一发，生产力之王！阳历元旦节我摸鱼了一下2019年终总结：2019年终总结-如果我的优秀伤害到了你 其实也是因为在做总结的过程中，感觉每个细节都是可以无限扩展，追求完美的后果就是没有产出。 Continue reading
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使用bedtools获取指定坐标上下游的序列
前些天给学徒演示了猪狗的参考基因组构建索引 就顺便布置了作业，有意思的是她下载的时候，在两个参考基因组文件里面犹豫不决： Continue reading
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使用ebi数据库直接下载fastq测序数据的改进脚本
昨天安排学徒分享了我们全国巡讲的生信爆款入门课，大家关于下载fastq测序数据最常见的问题，就是ncbi的sra数据库访问慢，学徒写了一个shell脚本批量从ebi数据库下载，然后被吐槽比较难懂，而且不智能。我稍微改进一下： Continue reading
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使用LncRNA2Function网页工具推测非编码RNA的生物学功能
如果我们最后拿到的是蛋白编码基因，当然可以很容易的注释到各种数据库，比如：Gene Ontology terms, KEGG, Reactome, NetPath, PID, INOH and BioCarta pathways ，这些数据库本质上都是一些被定义好的基因集而已。 Continue reading
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为什么我代码里面选择top1000的sd基因绘制热图呢
实际上写完了这个全网最好的差异分析代码：免费的数据分析付费的成品代码 我就可以收工了，但是永远不能低估粉丝的疑惑数量，任何一个细节都会被拿出来剖析。 Continue reading
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文献搜索数据库大全
王者级别
top1：谷歌学术搜索
谷歌学术比百度学术和Pubmed搜索的内容更丰富，更新更快，
大家可以去看看《自然》杂志对话谷歌学术共同创始人 Anurag Acharya，聊了聊谷歌学术的过去和未来。
top1：Sui-Hub
这个相信不用多说了，很多人都用过。你只需想要的论文URL地址或DOI，亦或Pubmed ID复制到搜索框中，即可搜到。原来需要付费的英文论文现在也可以直接免费下载了。 Continue reading
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我不相信kmplot这个网页工具的结果
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我想让这个视频免费需要你的同意
看到这个标题，大家可能会觉得奇怪，我们生信技能树的视频不都是免费的吗，一直在宣传2020学习主旋律，B站74小时免费教学视频为你领路 吗？实际上，如果你进去B站仔细看，就会发现我们的免费视频课程已经满100个小时啦，不过我们还有另外一个社群，就是单细胞天地。在单细胞天地我们有一个单细胞转录组数据分析基础课程和单细胞进阶课程，很少在生信技能树宣传罢了。 Continue reading