Daily Archives: 2016年7月1日

七 01

自学miRNA-seq分析第七讲~miRNA样本配对mRNA表达量获取

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这一讲其实算不上是自学miRNA-seq分析，本质就是affymetrix的mRNA表达芯片数据分析，而且还是最常用的那种GPL570    HG-U133_Plus_2，但是因为是跟miRNA样本配对检测的，而且后面会利用到这两个数据分析结果来做共表达网络分析等等，所以就贴出对该芯片数据的分析结果。文章里面也提到了 Messenger RNA expression analysis identified 731 probe sets with significant differential expression，作者挑选的差异分析结果的显著基因列表如下： Continue reading →

七 01

自学miRNA-seq分析第六讲~miRNA表达量差异分析

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这一讲是miRNA-seq数据分析的分水岭，前面的5讲说的是读文献下载数据比对然后计算表达量，属于常规的流程分析，一般在公司测序之后都可以拿到分析结果，或者文献也会给出下载结果。但是单纯的分析一个样本意义不大，一般来说，我们做研究都是针对于不同状态下的miRNA表达量差异分析，然后做注释，功能分析，网络分析，这才是重点，也是难点。我这里就直接拿文献处理好的miRNA表达量来展示如何做下游分析，首先就是差异分析啦： Continue reading →