我用rmarkdown写过的教程

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用rmarkdown写教程真心非常方便,尤其是R语言相关的,比如一些R包的应用,或者一些可视化,或者一些统计,下面我简单列出一些我以前写过的,图文并茂,关键是还非常省心,不需要排版,不需要上传图片,整理图片。

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如果你生信基本技能已经入门,需要提高自己,请关注上面的生信技能树,看我们是如何完善生信技能,成为一个生信全栈工程师。 Continue reading

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自学miRNA-seq分析第六讲~miRNA表达量差异分析

这一讲是miRNA-seq数据分析的分水岭,前面的5讲说的是读文献下载数据比对然后计算表达量,属于常规的流程分析,一般在公司测序之后都可以拿到分析结果,或者文献也会给出下载结果。但是单纯的分析一个样本意义不大,一般来说,我们做研究都是针对于不同状态下的miRNA表达量差异分析,然后做注释,功能分析,网络分析,这才是重点,也是难点。我这里就直接拿文献处理好的miRNA表达量来展示如何做下游分析,首先就是差异分析啦: Continue reading