Tag Archives: DESeq2

我用rmarkdown写过的教程

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用rmarkdown写教程真心非常方便，尤其是R语言相关的，比如一些R包的应用，或者一些可视化，或者一些统计，下面我简单列出一些我以前写过的，图文并茂，关键是还非常省心，不需要排版，不需要上传图片，整理图片。

一般来说看链接最后的文件名就知道这篇文章讲的是什么了：

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七 01

自学miRNA-seq分析第六讲~miRNA表达量差异分析

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这一讲是miRNA-seq数据分析的分水岭，前面的5讲说的是读文献下载数据比对然后计算表达量，属于常规的流程分析，一般在公司测序之后都可以拿到分析结果，或者文献也会给出下载结果。但是单纯的分析一个样本意义不大，一般来说，我们做研究都是针对于不同状态下的miRNA表达量差异分析，然后做注释，功能分析，网络分析，这才是重点，也是难点。我这里就直接拿文献处理好的miRNA表达量来展示如何做下游分析，首先就是差异分析啦： Continue reading →