12

第36周-时间序列表达矩阵揭示肿瘤转移的动态过程

时间序列表达矩阵揭示肿瘤转移的动态过程

肝癌很可怕,尤其是转移后,很多关于其转移前后对比的研究,但是缺乏中间过程数据,特别是转移临界点
作者通过肝癌模型,在不同时间点取样做芯片转录组,试图分析 non-metastatic (or normal) and pre-metastatic (or critical) 这两种状态区别。顺利找到了临界点及其相关调控网络,而且还重点分析了其中一个网络的最重要的节点基因:CALML3
To discover early warning signals of pulmonary metastasis in HCC, we analysed time-series gene expression data in the spontaneous pulmonary metastasis mouse HCCLM3-RFP model with our novel dynamic network biomarker (DNB) method.
构建了 xenograft HCCLM3-RFP mice , 20只小鼠分成4组,即4个时间点(W2, W3, W4, W5)取样。

Continue reading