limma真不愧是最流行的差异分析包,十多年过去了,一直是芯片数据处理的好帮手。
现在又可以支持RNA-seq数据,我赶紧试用了一下!
我下面只讲用法,大家看代码就明白了!
limma真不愧是最流行的差异分析包,十多年过去了,一直是芯片数据处理的好帮手。
现在又可以支持RNA-seq数据,我赶紧试用了一下!
我下面只讲用法,大家看代码就明白了!
最近经常出现一个错误,类似于package ‘airway’ is not available (for R version 3.1.0)
就是某些包在R的仓库里面找不到,这个错误非常普遍,stackoverflow上面非常详细的解答:
在阅读这个答案的时候,我发现了一个非常有用的函数!available.packages()可以查看自己的机器可以安装哪些包!
我以前写过DESeq,以及过时了:http://www.bio-info-trainee.com/867.html
正好准备筹集bioconductor中文社区,我写简单讲一下DESeq2这个包如何用!
感谢读者的指正,我以前写的一个程序是错的,从算法设计上就错了!
http://www.bio-info-trainee.com/926.html
我从新设计了一个算法,经过再三检查,我可以确信它是对的,至于是否高效,就不敢保证了,也希望有更多热心的读者帮助我改正,或者跟我讨论,请直接联系我的邮箱jmzeng1314 at(防爬虫) 163.com