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免费并不意味着质量差

昨天有粉丝看到了 转录组公益课(含单细胞)(名额有限,先到先得),发邮件给我说,实在是太激动了,之前去了解了各种单细胞培训班,动辄好几千而且才两天课程,很多都是“挂羊头卖狗肉”。但是导师一直push他去外面参加培训,舟车劳顿不说,还基本上没有收获。因为导师觉得免费的,或者低价的,肯定质量很差。 Continue reading

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基因表达量高低分组的cox和连续变量cox回归计算的HR值差异太大?

号外:绝大部分生信技能树粉丝都没有机会加我微信,已经多次满了5000好友,所以我开通了一个微信好友,前100名添加我,仅需150元即可,3折优惠期机会不容错过哈。我的微信小号二维码在:0元,10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》 Continue reading

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共享生信云服务器(64线程256G内存)内测半价活动

巧妇难为无米之炊,我们作为生信工程师如果没有一个趁手的服务器,很多ngs上游分析都无从谈起。
但是生物信息学在我们生信技能树这些年的大力推广下,已经走入生命科学领域寻常百姓家,大量湿实验工作者开启了他们的编程人生,大大的超出了服务器的配置速度。其实不同实验室不同课题,对服务器的需求不一样,可以简单总结如下: Continue reading

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差异基因没办法富集到通路你就放弃了吗

我在生信技能树分享了一个教程:不要怀疑,你的基因就是没办法富集到统计学显著的通路,强调了大家做生物信息学数据分析的同时,一定要加强统计学基础,比如把差异基因集(500个左右的基因)富集到KEGG数据库通路,本质上就是对每个通路单独做一次超几何分布检验罢了! Continue reading

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比较不同的肿瘤somatic突变的signature

前面我们详细讲解过,sanger研究所科学家【1】提出来了肿瘤somatic突变的signature概念 ,把96突变频谱的非负矩阵分解后的30个特征,在cosmic数据库可以学习它。不同的特征有不同的生物学含义【2】,比如文章【3】 就是使用了 这些signature区分生存!主要是R包deconstructSigs可以把自己的96突变频谱对应到cosmic数据库的30个突变特征。 Continue reading

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10个小时搞定科目一

上周五在三亚摘完芒果就飞往上海见了一下学徒,本来计划是周一飞往山西太原,有意思的是他们防疫政策很高效,要求所有的广东人都需要做核酸检测以及隔离,我就呵呵一下,果断不去了。恰好我的教练发朋友圈说科目一考场开放了,就报名约考周三上午。这样我周一飞回去休息下,第二天有一整个白天时间备考科目一,完美! Continue reading