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为难你了,选择生信技能树

最近有粉丝发邮件咨询我单细胞问题的时候,我指出来其实是因为他R语言知识不牢固,所以没办法从特定的S4对象里面提取内容,转录组基础也没有学习所以不明白文库是什么,其实就是说并不是单细胞本身知识点问题,所以推荐他去听我B站的全网第一个单细胞课程(免费基础课程),过两天他回信说太感谢我的教程了,之前确实是基础知识不够所以单细胞数据分析的很勉强,一步一个坑。 Continue reading

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使用SnpSift把vcf文件的变异位点注释到clinvar数据库

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遗传变异的数据库注释非常简单,就是从数据库里面下载记录文件,然后根据坐标对应一下即可,甚至很多成熟的工具都可以自动下载数据库以及比对,就跟我们前面讲到的把vcf文件注释到dbSNP数据库的ID一样简单。我在多年前的直播我的基因组讲过很多了: Continue reading

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生信技能树知识整理实习生招募

在生信技能树,生信菜鸟团,单细胞天地分享了超1.3万篇教程后,越来越感觉时间与精力不够用,且不说每日都要维持多个公众号的教程原创笔记撰写,仅仅是把这些教程发布出去,都是不小的工作量。目前我的教程同步更新在知乎,博客,腾讯云社区,简书,B站,论坛等平台,而且还有二十多个微信学习交流群需要维护,见: Continue reading

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生信技能树的融合基因教程系列合辑

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融合基因是由染色体重排而产生的,包括染色体的易位,插入,颠倒,缺失。基因融合也在肿瘤发生发展过程起重大作用,约2成的癌症患者死亡是因为有基因融合这样的突变。基因融合广泛发生在各种各样的的癌症,而且很多基因融合事件都具有癌症种类的特异性。非常知名的有: Continue reading