为难你了,选择生信技能树

最近有粉丝发邮件咨询我单细胞问题的时候,我指出来其实是因为他R语言知识不牢固,所以没办法从特定的S4对象里面提取内容,转录组基础也没有学习所以不明白文库是什么,其实就是说并不是单细胞本身知识点问题,所以推荐他去听我B站的全网第一个单细胞课程(免费基础课程),过两天他回信说太感谢我的教程了,之前确实是基础知识不够所以单细胞数据分析的很勉强,一步一个坑。
我也顺便回邮件安利了我们生信技能树官方举办的学习班

  • 数据挖掘学习班第4期(线上直播3周,马拉松式陪伴,带你入门),原价4800的数据挖掘全套课程, 疫情期间半价即可抢购。
  • 生信爆款入门-第6期(线上直播4周,马拉松式陪伴,带你入门),原价9600的生信入门全套课程,疫情期间3.3折即可抢购。
    给他,希望他可以推荐给身边的师弟师妹,这样就不用走他的弯路。
    他然后回邮件给我大吐苦水,其实导师本来就在去年就安排他参加了某单细胞培训班,但是课上仅仅是囫囵吞枣的跑了一个seurat官网代码,对自己的单细胞课题指导很有限。当初就应该是跟导师力争,而不是听导师安排去参加某乱七八糟的单细胞培训,因为本来就知道生信技能树和单细胞天地,也知道我们有学习班,但是不敢主动去找导师要经费来参课。
    这个沟通给我的感触很深,我们其实很清楚,上了年纪的导师其实是不可能知道生信技能树的,但是他们却很容易被各种新闻公众号吸引,关注的都是某某某课题组又发了CNS,里面的课题设计思路等等。但是低下真正搞技术的学生却仍然是得慢慢耕耘,一步一个脚印的掌握数据分析细节。导师收到的培训广告基本上都充满了营销套路,必然是很容易让他们上钩,而手握经费的他们就可以安排学生们去参课。
    而学生们呢,通常是接受“命运的安排”,敢于据理力争的很少,首先没有参加培训之前不可能知道那些营销套路培训质量有多差, 也不可能知道我们生信技能树的学习班是多么的完美。其次即使是对生信技能树教学团队有充分的了解,就是要违逆导师的安排,需要承担的责任确实很大。因为如果听导师的参加了一个很辣鸡的培训,即使学的很差也可以推脱责任到培训班,但是如果自己据理力争选择了生信技能树却没有学习好,后果就是自己独立承担。
    所以,非常感谢那些选择了我们生信技能树学习班来入门的一两百号学员,真的很不容易!
    我们不承诺任何教学效果,不承诺可以发文章,仅仅是用心做教程,用心授课,如果你们三天打鱼两天晒网,并没有坚持下来我们的马拉松式的陪伴,很有可能就入门而退,也就是说你们需要自己承担在导师那边的压力。

    参加一两天单细胞培训就入门?

    too young too simple !!!
    纯粹单细胞分析培训其实揠苗助长,没有一两年生信基础,数据分析实操环节基本跟不上的,流程细节方面也只能是听风就是雨。
    其实只需要你有生物信息学基础,我们有配套完整的视频让你彻底入门单细胞转录组数据分析啊!:7个小时的单细胞转录组视频课程(限时免费) 足足7个小时,34集,涵盖了单细胞转录组背景知识以及数据处理的知识体系,希望能够帮助到你的课题哦!
    包括上游流程,包括:

  • 单细胞实战(一)数据下载
  • 单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项
  • 单细胞实战(三) Cell Ranger使用初探
  • 单细胞实战(四) Cell Ranger流程概览
  • 单细胞实战(五) 理解cellranger count的结果
    而且不管你的课题是多少个单细胞样本, 都有发表的机会,见:
  • 我的课题只有一个10x样本肿么办?
  • 两个样品的10x单细胞转录组数据分析策略
  • 三个10X单细胞转录组样本CCA整合
  • 多个单细胞转录组样本的数据整合之CCA-Seurat包
    在教程:使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本seurat3的merge功能和cellranger的aggr整合多个10X单细胞转录组对比 我也给出了后续R代码读取10x单细胞转录组数据的3个文件的表达矩阵。

    需要哪些生信基础

    其实主要是计算机基础知识,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理

  • 生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)
  • 生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)
    把R的知识点路线图搞定,如下:
  • 了解常量和变量概念
  • 加减乘除等运算(计算器)
  • 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)
  • 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)
  • 文件读取和写出
  • 简单统计可视化
  • 无限量函数学习
    Linux的6个阶段也跨越过去 ,一般来说,每个阶段都需要至少一天以上的学习:
  • 第1阶段:把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅,主要目的就是去可视化,熟悉黑白命令行界面,可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。
  • 第2阶段:做到文本文件的表格化处理,类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余,查找,切割,替换,合并,补齐,熟练掌握awk,sed,grep这文本处理的三驾马车。
  • 第3阶段:元字符,通配符及shell中的各种扩展,从此linux操作不在神秘!
  • 第4阶段:高级目录管理:软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量
  • 第5阶段:任务提交及批处理,脚本编写解放你的双手
  • 第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我

    文末友情推荐

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