我是如何学习Gene Fusion分析的
一、Fusion原理
基因融合（Gene fusion）是指将两个或多个基因的编码区首尾相连，置于同一套调控序列（包括启动子、增强子和终止子等）的控制之下，构成嵌合基因。基因融合通常是由于染色体重排所造成的。异常基因融合事件可以引起恶性血液疾病以及肿瘤的发生，所以通过分析基因融合现象将有助于探讨发病机制、biomaker的筛选等，临床意义重大。 Continue reading
十一
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Daily Archives: 2017年11月2日
十一
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一个植物转录组项目的实战
其实这个植物是拟南芥，所以跟人类研究的数据处理大同小异。
转录组
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有 RNA 的总和，包括 mRNA 和非编码 RNA 。通过转录组测序，能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息，从而进行转录本结构研究、变异研究、基因表达水平研究以及全新转录本发现等研究。 Continue reading
十一
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LncRNA课题整体解决方案平台
LncRNA是一类长度超过200nt的非编码RNA分子，人类基因组中只有约3%的序列编码蛋白质，除去非转录区，其余约70%的序列转录产生非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA )。以往被认为是Junk DNA的基因组序列，现在被证实很多转录后变成了长非编码RNA。因此，LncRNA领域的研究堪比哥伦布发现的新大陆。随着高通量测序技术的发展，越来越多的LncRNA被注释。然而绝大多数LncRNA的功能效应及效应机制尚不得而知，探索这一广阔的未知领域正逐渐成为当今生物医学最热门的研究领域之一。