十一 23

使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv

cnvkit被设计来处理同一个批次的多个肿瘤配对样本测序情况，首先对所有的normal数据进行bin处理拿到背景值，然后就这个背景值来处理所有的tumor测序数据计算拷贝数变异情况。

该软件使用比较复杂，建议读一读官网教程。所有的命令都被包装到一个python脚本里面，使用该脚本调用一系列字命令，如下：

十一 23

本周专题是介绍

生信技能树论坛的生信基础板块，本篇是其中的“在线应用-网页版工具“版块，会对目前此子版块中的文章进行一个汇总整理（截止2017.11.26）。

本章节作者：hope

十一 23

如果你是最近关注我们，你将又知道一个学习生信的好地方；

如果你是一直关注我们，你肯定对这个地方不陌生；

那就是我们的生信技能树论坛(附上网址：http://www.biotrainee.com/forum.php)。

本周我们将为大家带来论坛-生信基础版块的介绍。

今天给大家推送：计算机基础

作者：华农-钱胜