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找变异的流程

找变异简单点说,就是把高通量测序得到的成千上万条序列片段比对到合适的参考基因组,找到那些成

功比对的片段与参考基因组的微小差异情况。 那么就涉及到存储测序数据的fastq数据格式,比对的工具,比对后的sam格式,找微小差异的工具,差异结果的vcf文件,每个步骤的软件选择,参数 调整。当然,最重要的是走通整个流程,明白自己在做什么。

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