最近刷到了2023年2月的一个数据集是GSE218974的单细胞转录组文献，标题是：《Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance》，该研究主要是想探索： intratumoral heterogeneity of RMS cell lines and primary cultures derived from patient-derived xenografts (PDXs).
涉及到的数据样品是 14 RMS PDX-derived primary cultures and 3 conventional aRMS cell lines ，简单的单细胞转录组数据分析，降维聚类分群，可以看到，如果不对这些样品进行整合，就是每个样品独立成群，这个是恶性肿瘤细胞的特性。当然了，如果强行走一下整合这个算法，也是可以抹平病人异质性的这样的话后续的分群就是功能性亚群： Continue reading
三
26
