十二 18

生信技能树论坛-生信社区版块-bioconductor中文&shiny交互网页

bioconductor中文
shiny交互网页
今天给大家介绍的是论坛的生信社区版块,包括bioconductor中文和shiny交互网页这两部分。
【真诚欢迎你】我们很多版块都需要补充和完善,如果你愿意加入我们一起建设论坛,我们非常欢迎,相信这个过程你一定能收获很多,快到碗里来吧,有能力有担当的朋友请与我们联系。:)
(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-研究热点版块介绍(三)-芯片处理

今天我们继续对论坛研究热点版块进行介绍,本文是第三篇,讲的是芯片处理这个热点。本文对热点的内容简单分了下类。如果你很感兴趣,请不要错过下文这些精彩的内容哦。若你想分享自己的学习资源和学习心得,欢迎你在对应的区域发帖,帮助更多对这部分内容感兴趣的人。:)
【真诚欢迎你】我们很多版块都需要补充和完善,如果你愿意加入我们一起建设论坛,我们非常欢迎,相信这个过程你一定能收获很多,快到碗里来吧,有能力有担当的朋友请与我们联系。:)
(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-研究热点版块介绍(二)-肿瘤信息学

今天我们继续对论坛研究热点版块进行介绍,本文是第二篇,讲的是肿瘤信息学这个热点。本文分为四部分,第一部分主要介绍TCGA数据下载和整理等方面的内容;第二部分主要介绍肿瘤研究领域一些重要的知识;第三部分为一些比较实用的方法和资讯方面的内容;最后一部分为问答区。如果你很感兴趣,请不要错过下文这些精彩的内容哦。若你想分享自己的学习资源和学习心得,欢迎你在对应的区域发帖,帮助更多对这部分内容感兴趣的人。:)
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十二 18

生信技能树论坛-研究热点版块介绍(一)

三代测序、化学信息学
免疫研究、GWAS
Meta分析、单细胞测序
进化分析、机器学习
今天我们将对论坛研究热点版块进行介绍,本文是第一篇,讲的是开篇提到的这几个热点。如果你很感兴趣,请不要错过下文这些精彩的内容哦。若你想分享自己的学习资源和学习心得,欢迎你在对应的区域发帖,帮助更多对这部分内容感兴趣的人。
【真诚欢迎你】我们很多版块都需要补充和完善,如果你愿意加入我们一起建设论坛,我们非常欢迎,相信这个过程你一定能收获很多,快到碗里来吧,有能力有担当的朋友请与我们联系。:)
(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-组学大全版块-转录组&基因组

转录组
基因组
今天我们讲述的是论坛组学大全版块的转录组和基因组。这两个组学,在论坛都有很大不错的内容。比如转录组,今年暑假我们就开展了转录组入门学习活动,有很多人参与,有些朋友还在论坛留下了宝贵的笔记。这些笔记记录了每个参与者的成长过程,作为一个参与者和见证者,我非常感谢和怀念那段时光。关于基因组方面,jimmy大神有个“直播我的基因组”,非常不错。更多详情请看下文吧。
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(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-组学大全版块-蛋白质组&微生物组&代谢组

蛋白质组
微生物组
代谢组
今天我们将对论坛的组学大全版块进行介绍,本文讲述的是蛋白质组、微生物组以及代谢组版块。关于这部分内容,我们有实战分析,有优质笔记,以及一些文献分享,详情请看下文。
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(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-互动作业版块-脚本能力实践&公共资源下载&项目实战

脚本能力实践
公共资源下载
项目实战
本文主要介绍了生信技能树论坛的互动作业版块的三个部分。脚本能力实践,这部分包括perl和Python的一些入门练习题,以及其他一些脚本相关的小技巧;然后是公共资源下载和项目实战这两部分,有介绍数据下载技巧,有介绍ChIP-Seq数据分析实战的,详情请看下文。
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(2017.12.15)

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十二 18

生信技能树论坛-在线应用-大分子表达量数据库&遗传变异资源数据库

遗传变异资源数据库

本文介绍了生信技能树论坛的在线应用版块的大分子表达量数据库遗传变异资源数据库,因为内容比较少,所以把这两个整合在一起了。内容方面,既有知识总结,又有数据库方面的介绍,还有果子大神以前遗留的待解决问题。
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(2017.12.15)

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十二 14

使用SGSeq探索可变剪切

可变剪切是指mRNA前体以多种方式将exon连接在一起的过程。 由于可变剪切使一个基因产生多个mRNA转录本,不同mRNA可能翻译成不同蛋白。

可变剪切背景知识

转录组一般是指从细胞或组织的基因组所转录出来的RNA的总和,包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA(rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,lncRNA,microRNA等)。真核生物的基因结构是不连续的,如下图:

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十一 26

生信技能树论坛-组学大全板块-表观组

如果你是最近关注我们,你将又知道一个学习生信的好地方;
如果你是一直关注我们,你肯定对这个地方不陌生;
那就是我们的生信技能树论坛(附上网址:http://www.biotrainee.com/forum.php
本周我们将为大家带来生信技能树论坛-组学大全板块-表观组的介绍:

今天给大家推送:组学大全板块-表观组

作者:中科院-徐鹏

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十一 26

生信技能树论坛的生信基础板块-可视化

如果你是最近关注我们,你将又知道一个学习生信的好地方;
如果你是一直关注我们,你肯定对这个地方不陌生;
那就是我们的生信技能树论坛(附上网址:http://www.biotrainee.com/forum.php)。。)
本周我们将为大家带来论坛-生信基础版块的介绍。

今天给大家推送:可视化版块

作者:钱胜

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十一 24

生信技能树论坛的生信基础板块-统计学

如果你是最近关注我们,你将又知道一个学习生信的好地方;

如果你是一直关注我们,你肯定对这个地方不陌生;

那就是我们的生信技能树论坛(附上网址:http://www.biotrainee.com/forum.php)。

本周我们将为大家带来论坛-生信基础版块的介绍。

今天给大家推送:生信基础板块-统计学

作者:王HH

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十一 23

使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv

cnvkit被设计来处理同一个批次的多个肿瘤配对样本测序情况,首先对所有的normal数据进行bin处理拿到背景值,然后就这个背景值来处理所有的tumor测序数据计算拷贝数变异情况。

该软件使用比较复杂,建议读一读官网教程。所有的命令都被包装到一个python脚本里面,使用该脚本调用一系列字命令,如下:

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十一 23

生信技能树论坛-生信基础版块介绍-计算机基础

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如果你是一直关注我们,你肯定对这个地方不陌生;

那就是我们的生信技能树论坛(附上网址:http://www.biotrainee.com/forum.php)。

本周我们将为大家带来论坛-生信基础版块的介绍。

今天给大家推送:计算机基础

作者:华农-钱胜

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十一 20

生信技能树论坛-生信基础版块介绍-生物学基础

# 生信技能树论坛-生信基础版块介绍-生物学基础


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那就是我们的生信技能树论坛

本周我们将为大家带来论坛-生信基础版块的介绍。

今天给大家讲解:生物学基础板块

作者:lakeseafly

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