免疫组库测序（Immune Repertoire Sequencing，IR-Seq）是非常小众的产品，并不属于TCGA的7种数据（WGS,WES,RNA-seq,miRNA,450K等等），所以我并没有在B站录制公益教学视频。
有趣的是，最近突然接到了一些粉丝求助，关于免疫组库数据处理的。所以就系统性的整理一下相关知识点，并且带领大家实战演练一个完整的免疫组库测序数据项目分析流程哈。 Continue reading →

有学徒提问，根据我b站课程，知道了org.db包是有规律的，比如： Continue reading →

《道德经》“玄之又玄，众妙之门”

gsea和gsva算法大家应该是都很熟悉了，我也多次讲解：

• GSEA分析一文就够（单机版+R语言版）

• GSEA的统计学原理试讲

• GSVA或者GSEA各种算法都是可以自定义基因集的 Continue reading →

众所周知，我们生信技能树的教学团队提供的付费产品服务就两个：

• 生信爆款入门-全球听（买一得五）（第4期），你的生物信息学入门课
• 数据挖掘第2期（两天变三周，实力加量），医学生/临床医师首选技能提高课 Continue reading →

又是一个年度更新帖，主要是看到了粉丝留言，对我前面(2018及2019年)分享的个人计算机推荐 信息的更新： Continue reading →

不知道多久以前在朋友圈看到转发分享：因为疫情，Johns Hopkins的Project Muse 限时免费，包括普林斯顿、康奈尔、乔治亚、哈佛、港中文、ACA、Early Theatre等40多家出版社基本都开放了自己的电子资料库，共有近24000本原版英文书，282本期刊。 链接是：https://about.muse.jhu.edu/resources/freeresourcescovid19/ Continue reading →

前些天为了帮助广大粉丝度过难关，所以开放了生信技能树全平台的招聘信息，见：还说啥呢，继续免费啊，而且里面还有一个是：购买入门级服务器免费送Linux直播培训服务，有粉丝留言说之前我们还赠送服务器的，现在居然还要自己购买，这免费活动不诚心啊！我连忙删除了这个留言还把它拉黑！ Continue reading →

非常多的粉丝在我们生信技能树后台留言询问，为什么他/她关注的基因明明是癌基因，明明是在肿瘤病人高表达（TCGA数据库搜索后的结果），但是却发现它对生存的影响居然是保护因子！（同样的网页工具）

所以我这里安排一个学徒作业，大家需要去下载TCGA数据库的BRCA这个癌症的芯片和RNA-seq的表达矩阵，分别进行差异分析，拿到统计学显著的上下调基因列表。 Continue reading →

任何一个编程语言， 要想足够好用，都必须要有完善的代码调试机制，毕竟谁写代码还不碰到几个bug呢。

比如R语言编程，简单的R代码调试，其实靠head，str，help函数即可。所以我从强调初学者应该是要至少把这3个函数敲1000遍以上。比如，群里有人问它的表达矩阵里面的探针ID，跟他准备好的探针ID与基因对应表格， 无法匹配，自己在Excel手动搜索，明明是每一个探针都存在于准备好的探针ID与基因对应表格里面。 Continue reading →

最近有朋友发给我一个很有意思的招聘： Continue reading →