数据挖掘第一期学习反馈

众所周知,我们生信技能树的教学团队提供的付费产品服务就两个:

  • 生信爆款入门-全球听(买一得五)(第4期),你的生物信息学入门课
  • 数据挖掘第2期(两天变三周,实力加量),医学生/临床医师首选技能提高课
    当然了,绝大部分粉丝(因为早已是生信工程师了的)都是用不上的,因为我们仅仅是对十万粉丝里面的两三百个有经费,负基础的朋友提供手把手的入门帮助,属于雪中送炭行为。
    如果有这样的需要的朋友却没有看到我们产品,只能是他运气太差,不够努力,我们是为他感到可惜。我们的产品无需牛皮癣广告,也无需营销套路,那一两百人需要帮忙的朋友不选择我们,其实是他们的损失。
    对剩余的十万粉丝来说,我也只能说抱歉,我不想为你们提供付费产品,所以你可以看到我们的生信技能树的2019年终总结 ,你的生物信息学成长宝藏,以及2020学习主旋律,B站74小时免费教学视频为你领路 ,我非常的相信你肯定是受益过,所以还留在我们的十万粉丝队伍里面!
    这两个课程是钉钉群直播教学,当然也提供录播视频回放,目前看来是非常成功的线上教学实践。长达3,4个星期,连续十几二十天的授课。堪比哈佛12天入门生信的教学活动,而且价格感人,平均每天不到30美金,也就是每个小时10美金不到,比麦当劳肯德基小时工薪水还低!
    考虑到很多人犹犹豫豫不清楚有专业的教学团队带领着学习是是一种什么样的体验,特意分享一位学员的真实故事,无删减!
    by 番茄

    DAY1

    决定报数据挖掘的培训班是因为在前一周跟着花花老师的生信星球入了一点点门,在花花和豆豆类似“傻瓜式教学”的教程下成功克服了一点点对生信的恐惧,感觉很不错,加之课题正好需要这方面的学习,便决定继续跟着花花学生信。
    之前就听说课上不止会讲知识,还会讲“哲学”,今天脑海中记住的就是“不要慌”和“试试”。在Jimmy大佬简短的开场白之后,花花便开始了教学。
    第一节课,内容上比较简单,容易接受;三个小时,讲练结合,会跟同学互动,不会只有干巴巴地听课,做完题还会有解释和答疑,关注到每位同学的问题,虽然我问的问题不在授课范围内,花花还是耐心的讲解了,很nice
    另外,花花的声音很有激情,听课不会犯困,明天继续加油。
    2020.4.6

    DAY2

    我好像有一种只要老师说了不重要就不想听的毛病……
    比如今天最后讲向量排序的时候,而且花花说自己也会被绕晕,然后我就有点不想听了,结果跑了一点神后来就跟不上了,可能也是不太理解,课下还需自己多练习领悟不同命令下排序的结果区别。
    这部分建议花花今后课程可以再改进一下。
    2020.4.7

    DAY3

    昨天上课有同学说回放效果也挺好,我去试了下,开了二倍速,还不错。可以很迅速的过完讲过的视频,而且补充笔记,复习时挺好用。
    今天Jimmy老师在群里发了一个小练习,我想到的是最笨的方法c(x,x,x,x,x,x),经课堂提醒才发现原来还可以这样或那样实现,深感掌握概念和实际应用之间的差距还需日常多加练习来弥补。
    而且,今天听的有点吃力,同样是感觉听懂了但一做练习就不行了,练习题在规定的时间里没有做完,看来以后需要提前预习了,另外,讲练结合的方式很棒,花花讲课很棒很清楚很有活力。
    觉得课堂上老师该讲的已经讲的很细致了,后面就需要自己复习回顾以及预习了,否则以后可能会跟不上。
    2020.4.9

    DAY4

    数据类型和数据结构告一段落了,前两天听的有点懵,花花带着顺了一遍感觉有点捋顺思路了,觉得带着捋一遍这个操作太有必要了。今天主要讲R包和文件读写,老实讲我在这部分问题不是很大,相比前两天感觉难度有所缓解。
    我和R语言的斗争可以说是从装包开始的,刚开始装包时啥也不懂,看见报错就头大,各种问人如何解决的同时被告诉最多的建议是网上搜一搜,因为对我这种水平来说,我犯过的错别人一定都犯过了,所以就慢慢学会了看报错,搜报错,装依赖包,本地安装,最后发现一个贼好用的办法——科学上网。今天花花讲的差不多涵盖了当初我遇到的所有问题,总结的很全面。
    感觉连着上三个小时挺长时间的,花花把内容安排的挺紧凑,也不枯燥,感觉很用心在教了。
    2020.4.10

    DAY5

    今天讲的文件读写是我期待已久的!之前搞了一个tsv格式的数据倒腾很久才读进去R,然而今天花花讲了这么多种方法都可以,太棒了!
    花花说这部分有点枯燥,我感觉还好,可能是我有需求有问题吧,会听的仔细些。不过后面讲练习题的时候的确有点无聊……
    R语言基础到这里差不多就结束了,接下来就该画图和进阶了,上层建筑很重要,底层基础更重要,这几天有时候课上的练习题没有做完,笔记也没整完,接下来还需要花时间复习一下。
    2020.4.11

    DAY6

    都说R语言作图功能很强大,在paper中也的确看到各种好看的大图,一直是东搜集些代码西搜集些代码,不系统不全面。
    今天终于正式开始学习R语言作图部分了,从基础作图到ggplot2,把数据以好看的图片呈现出来,然后还能调整各种细节,还挺有趣的!
    2020.4.13

    DAY7

    今天继续讲了些哈德雷大佬写的R包,感叹大佬果然是大佬啊,写的包都很有魅力和特色。
    感觉条件和循环好难啊,听的迷迷糊糊,好像听懂了,做课堂练习却有点不知道从何入手,唉…。
    由于这次课程和下次课程中间空了两天,就把之前的稍微复习了下,复习时会产生一些新的问题,正想记下来回头问的时候就发现花花下一句的解释了,感觉好神奇,有时候在别的同学的问题中也发现了自己想问的问题,就是每次听课总能发现新的知识点,有所收获。还有,要感叹下自己花钱报这个班挺对的,老师和同学都很优秀。
    突然发现到今天课程已经进行一半了,时间真的过的好快。
    2020.4.14

DAY8

今天扫了下R语言的尾巴,开始GEO了。久闻GEO大名,今天是第一次开始接触,一些背景知识,比较容易理解。
花花老师讲的通俗易懂,最后到去重复探针的时候我有点懵,因为一直在想甲基化探针了,纠结了一晚上第二天在群里问了,才发现是自己把研究对象搞错了,不能套用,记住了。
2020.4.16

DAY9-DAY10

这两天实战,发现R语言基础真的很重要,有些又忘了,还得复习。
整体上不是很难,还讲到了我心心念念的配对差异分析和去除批次效应,也去花花老师Github上找到了代码,需要继续学习理解。
在这里有个建议,我们做分析最主要的目的是为了找差异,前面铺垫了很多整理数据的部分,也都是为了最后找差异,我建议老师可以把一些重要参数稍微说一下,会有助于更好的应用到其他方面。
2020.4.18

DAY11

终于要开始TCGA了,期待了好久。
今天初试了用官方工具下载数据,花花讲的很细致。两个月之前我探索过甲基化数据,选好后去购物车一看竟然56G,劝退了,今天发现原来RNAseq数据这么小啊,是不是可以换个思维,先搞一搞rnaseq。
2020.4.20

DAY12

白天在重复前一天晚上讲的东西的时候接连出错,首先是下载数据出来莫名其妙的错误,然后重新试了几遍神奇的好了,接着又是最后结果不对了,又拐回去重新听课,终于找到了错误得到了正确的结果,发现自己跳得坑其实花花已经讲过了…
晚上又讲了三大包差异分析,在这我又看到了limma,这里用的是0+,表达矩阵没有用,虽然上次Jimmy老师发了个帖子讲二者区别,但还是不太理解…,可能以后用的时候还会纠结,有点烦躁。
2020.4.21

DAY13-DAY15

一连串的TCGA,干货满满,感觉背景知识很重要,否则很容易懵,需要去补一补RNA的世界了。
另外,这几天很不顺利,首先下数据就卡死了,一直下不下来,下到崩溃,其实每次在群里问数据下载有问题的时候都有点纠结,会担心老师会不会嫌烦,会想别的小伙伴怎么都下下来了…好在花花老师每次都热心负责的出来帮我,最后还帮我下载数据,有点感动,感谢老师。
本来是最后一天了,然而花花老师要给我们继续加餐,太棒了!
2020.4.25

DAY16

最后一天了,感觉都快习惯了每天晚上跟着花花老师三个小时的学习,时间好快。
总结一下连续了三周的数据挖掘第一期:
团队很用心,不能说包教包会,但是有着一颗想让我们每个人都学会的心,老师和助教都很认真负责,不只是授人以鱼,更是授人以渔,最后还有彩蛋,整个过程收获满满,很棒。
花花老师对R语言的热爱,对工作的热情,以及整个团队无私的分享,让我感觉自费上这个补习班很值得,哈哈。
还有一点建议,感觉TCGA部分可以最后讲的这篇文章为主线,从数据下载到文章复现,中间可以加一些三大R包差异分析比较,这样脉络会更清晰,学员接受度更高。
最后,再次感谢所有老师的付出,可能疫情在家最对的一件事就是自己报班逼着自己学习,而且还遇到了最优秀的团队上了最优秀的课。
2020.4.28

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