本周尝试一种新的文献解读方式，就是一次性解读3篇文献，总结他们的异同点，整体把握该领域发展情况。
发表在2018年9月的NC, 文章是：Acquired cancer resistance to combination immunotherapy from transcriptional loss of class I HLA 两例免疫治疗患者，在一位患者身上发现了规律，在另一位患者身上得到了证实。取患者血液和肿瘤，做免疫组化、分选、exome-seq、single cell RNA-seq、qPCR。 Continue reading
文章发表于：Breast Cancer Res. 2016; 通过对188个乳腺癌患者样本的450K甲基化芯片，无监督聚类可以分成7组，而且还跟TCGA计划的数据做了比较，而且是多组学层面的比较。 Continue reading
乳腺癌是高度异质性疾病，临床分期及病理分级相同的患者对治疗的反应和预后大不相同。 但是目前仍然是根据临床病理特点如HER2表达、雌激素受体状态、肿瘤大小、分级和淋巴结转移等选择辅助治疗，包括化疗，内分泌治疗，抗HER2治疗等。
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早在2018年第46周文献分享，我就介绍过TNBC亚型的研究：https://zhuanlan.zhihu.com/p/49574829 研究团队通过贝勒医学院分两次 收集了 198个TNBC病人， (discovery set: n=84; validation set: n=114) 比较稳定的把TNBC分成了4个亚型，而且还分析了7个公共数据集来验证其结论。作者还整理的4个亚型以及其可能的靶点，作为研究亮点。当时也展开对比了其它分类研究，因为目前TNBC是BRCA里面预后最差的， 所以关于它的研究比较火热，但是根据基因表达进行分子分型的到不多，值得系统性的通读一遍，争取完全掌握该小领域的研究脉络。 Continue reading
首发于生信技能树微信公众号：https://mp.weixin.qq.com/s/wWFYLBIfexaP1PuhqgcA9w Continue reading