前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史，也简单过了broad开发的inferCNV软件，在其提供的测试数据上面成功运行了，也测试了airway这个转录组数据，但是效果不好，现在看看CCLE数据库的测试结果吧，比较文章里面对之进行过同样的处理。
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Daily Archives: 2018年3月24日
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使用inferCNV来推断airway转录组数据的拷贝数变异
使用inferCNV来推断airway转录组数据的拷贝数变异
前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史，也简单过了一半broad开发的inferCNV软件，但是只运行了其测试数据，远远不够。
现在我们来，使用inferCNV来推断airway转录组数据的拷贝数变异，其实主要就是如何制作input文件给inferCNV这个软件，要制作的数据文件如下：