使用broad出品的inferCNV来对单细胞转录组数据推断CNV信息
软件项目地址: https://github.com/broadinstitute/inferCNV.git
我在 https://mp.weixin.qq.com/s/Qns9TCSgNg_CQuwQxQbVnw 里面讲到了对单细胞转录组数据推断CNV信息的历史文献。其实看懂那些文件的补充材料的对单细胞表达矩阵的处理描述后是可以自己写代码来分析的,但是难度有点大,我们先来体验一下作者的软件。
软件项目地址: https://github.com/broadinstitute/inferCNV.git
我在 https://mp.weixin.qq.com/s/Qns9TCSgNg_CQuwQxQbVnw 里面讲到了对单细胞转录组数据推断CNV信息的历史文献。其实看懂那些文件的补充材料的对单细胞表达矩阵的处理描述后是可以自己写代码来分析的,但是难度有点大,我们先来体验一下作者的软件。
这应该是关于PRC复合物的第一篇单细胞转录组数据吧,文章是2016年10月接收的,Flipping between Polycomb repressed and active transcriptional states introduces noise in gene expression Continue reading