熟悉我的人都知道RNA-seq是我的拿手好戏啦!
但是,今天处理了一个公共数据,比对率低的惊人!
是测序数据质量不好?
难道grcm38与mm10有差别?
还是比对工具的默认参数不行?
请看下去,看看老司机是如何翻车的!
大家不要点击,我把这个博客当做笔记本的,这个知识点对你们几乎木有用的!
Universal Human Reference RNA 似乎是agilent公司的,包含了10个不同的人类细胞系!roadmap对这些样本测了RNA-seq,我以后课题可能会用得着。
列表如下: Continue reading