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大型基因组拼装的乐高软件之MaSuRCA assembler使用指南

本文转载自 生信技能树 论坛特约作者MintMaSuRCA assembler 软件指导书,非常符合我博客的风格,也正式开启了我博客的转载之路。(前面的近400篇文章都是本人原创,手打,但是精力有限,以后文章更新频率会大大降低,但是会引入不少 技能树论坛特约作者的 好文!) Continue reading

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用Miniconda,Bioconda来安装常见的生物信息学软件

这是生信技能树论坛的朋友推荐的,我试用了一下,的确非常方便~
生信最基础的基本功便是常用软件的安装和配置,但是不是所有软件都可以直接使用的[比如 annovar 等]。除了安装编译,有些软件所需环境的配置同样令人头疼。会不断报错提醒你那些东西没有安装。
    bioconda里面几乎涵盖了引用率较高的,好用的工具的打包资源,一键式安装,并且各自依赖的环境相互分隔,每次使用source activate env_name 来激活。使用source deactivate 来退出。具体软件列表见:https://anaconda.org/bioconda/repo 但是列表不支持搜索,可以去它的github里面去搜索  https://bioconda.github.io/
    而且不需要root权限也可以安装软件。

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