千人基因组计划的重要性我也不想多说了，由于时间跨度比较长，最终的数据不只是一千人，最新版共有NA编号开头的1182个人，HG开头的1768个人！它的官方网站是：有一个ppt讲得很清楚如何通过官网做的data portal来下载数据：https://www.genome.gov/pages/research/der/ichg-1000genomestutorial/how_to_access_the_data.pdf 我不喜欢可视化的界面，我比较喜欢直接进入ftp自己翻需要的数据，千人基因组计划不仅仅有自己的ftp站点，而且在NCBI，EBI和sanger研究所里面也有数据源可以下载， 是非常丰富的生信入门资源！
NCBI的重要性我就不多说了，Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库，设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据，但是后来也加入了甲基化芯片，lncRNA，miRNA，CNV芯片等各种芯片，甚至高通量测序数据！所有的数据均可以在ftp站点下载：ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/geo/ Continue reading
想了想，既然是菜鸟教程，那就索性再介绍点更基础的东西，基本上只要是大学毕业的都能看懂，不需要懂计算机了。首先讲讲linux服务器吧，因为生物信息也算是半个大数据分析，所以我们平常的办公电脑一般都是不能满足需求的，大部分实验室及公司都会自己配置好服务器给菜鸟们用，菜鸟们首先要拿到服务器的IP和高手给你的用户名和密码。
一般我们讲服务器，大多是linux系统，而我这里所讲的linux系统呢，特指ubuntu，其余的我懒得管了，大家也不要耗费无谓的时间纠结那些名词的不同！
登录到服务器有两种方法，一种是ssh，传输你的命令给服务器执行，另一种是ftp，和服务器交换文件。而ssh我们通常用putty，xshell等等。ftp呢，我们可以用winscp，xshell，所以我一直都用xshell，因为它两者都能搞定！
Xshell软件自行搜索下载，打开之后新建一个连接，然后登陆即可。
然后输入以下命令，可以查看服务器配置，包括cpu。内存，还有硬盘
cat /proc/cpuinfo |grep pro|wc -l
free -g
df -h
这个服务器配置好一点，有80个cpu，内存256G，硬盘有2个11T的，是比较成熟的配置。
这个是一个小型服务器。也就24个核，64G的内存，但是存储量有点小呀，其实可以随便花几百块钱买个1T的硬盘挂载上去的。
然后linux的其它命令大家就得自己去搜索一个个使用，然后熟悉，记牢，然后创新啦！
我随便敲几个我常用的吧： ls cd mkdir rm cp cat head tail more less diff grep awk sed grep perl 等等！
呀，突然间发现我才介绍了ssh的方法登陆服务器并且发送命令在服务器上面运行，下面贴图如何传输文件。一般xshell的菜单里面有绿的文件夹形式的标签就是打开ftp文件传输，这种可视化的软件，大家慢慢摸索吧！
