CD分子吧,它是Clusters of Differentiation的简写,是指一组分化抗原的家族,目前该家族已经有CD1——CD350甚至更多的成员.他们分布于T细胞等免疫细胞表面,参与免疫细胞各种表达,其中有整合素、受体、配体等蛋白分子,在免疫应答反应中参与识别、粘附和信号转导等功能.

我这里简单讲讲如何整理它们的基因信息，首先从NCBI里面下载的人的gene_info文件，然后通过脚本来查找CD分子信息。

perl -alne '{if (/\tCD\d+/ or /CD\d+\|/ ) {print}}' human_gene_info >CD.info

cut -f 2-5 CD.info >CD.table

再根据CD分子的排序把我们的信息重新排序

perl -alne '{/CD(\d+\w)/;$hash{$1}=$_}END{print $hash{$_} foreach sort {$a <=> $b}keys %hash}' CD.table >CD.table.sort

然后我发现了一个很有趣的问题，它们都是负义链上面的基因！