为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹，加州举行的会议中发起了泛癌计划。参考：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6000284/ 为此我也录制了系列视频教程在：TCGA知识图谱视频教程（B站和YouTube直达）
本文发表于 Nature. 2013 Oct ， 引用已经超2000了，题目是：Mutational landscape and significance across 12 major cancer types. 这可能是第一个pan-cancer研究发了CNS正刊，样本量是 3,281 tumours across 12 tumour types ，针对他们的突变信息，使用 MuSiC 来计算 significantlymutated genes (SMGs)，主要是 20 cellular processes的127个基因的特征。 Continue reading →

为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹，加州举行的会议中发起了泛癌计划。参考：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6000284/ 为此我也录制了系列视频教程在：TCGA知识图谱视频教程（B站和YouTube直达）
本文发表于Nat Genet. 2013 Oct;题目是： Emerging landscape of oncogenic signatures across human cancers. 主要关心其定义的selected functional events (SFEs)，系统性的研究TCGA数据库的12个癌症的3299个病人数据，并且把癌症病人分成 mutations (M class) or copy number changes (C class) 两个组。文献解读属于100篇泛癌研究文献系列，首发于：http://www.bio-info-trainee.com/4132.html Continue reading →

为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹，加州举行的会议中发起了泛癌计划。参考：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6000284/ 为此我也录制了系列视频教程在：TCGA知识图谱视频教程（B站和YouTube直达）
本文发表的杂志还算中规中矩啦，在Nat Commun. 2013，题目是：Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data. 本研究者开发了一个基于表达信息的肿瘤纯度判定算法，Estimation of STromal and Immune cells in MAlignant Tumours using Expression data’ (ESTIMATE) 主要是基于ssGSEA，对 stromal and immune 两个基因集进行打分。文献解读属于100篇泛癌研究文献系列，首发于：http://www.bio-info-trainee.com/4132.html Continue reading →