为了完成这个小探索,遇到了一个以前从来没有注意的问题,就是不同数据库对基因注释的记录差异问题。
三
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为了完成这个小探索,遇到了一个以前从来没有注意的问题,就是不同数据库对基因注释的记录差异问题。
因为昨天看到了TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 包来获取基因的坐标及长度跟其它主流数据库有差异,所以今天彻底比较一下TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 包和CCDS数据库的差异。
详见:https://mp.weixin.qq.com/s/2QJvQxVECcxpJIsId1pHYA Continue reading