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下游分析其实跟产生单细胞转录组测序数据的protocol关系不大,反正都是表达矩阵,但是上游分析的表达矩阵如何获得,这个问题就很大程度上依赖于所采取的单细胞转录组技术了,是否使用spike-in,是否使用UMI, barcode策略是咋样的,等等,都需要考虑。
下游分析其实跟产生单细胞转录组测序数据的protocol关系不大,反正都是表达矩阵,但是上游分析的表达矩阵如何获得,这个问题就很大程度上依赖于所采取的单细胞转录组技术了,是否使用spike-in,是否使用UMI, barcode策略是咋样的,等等,都需要考虑。