这是发布在bioconductor平台上面的一个数据库文件，可以通过R里面下载安装并使用，非常方便。而且用的是数据库存储方式，所以搜索起来也是非常快速。

这个包里面有28个主流数据资料文件，这样我们可以用select函数根据我们自己的ID在这28个数据库里面随意转换自己想要的信息！！！

当然我本人是比较喜欢直接下载原文件，然后写脚本自己进行各种数据直接的转换。

首先我们加载这个数据包，可以看到这个数据包依赖于很多其它的包，如果是第一次安装。会耗时很长！

用这个函数，可以看到这个org.Hs.eg.db数据对象里面包含着各大主流数据库的数据，一般人都比较熟悉的entrez ID 和ensembl 数据库的ID。

keytypes(org.Hs.eg.db)

##  [1] "ENTREZID"     "PFAM"         "IPI"          "PROSITE"

##  [5] "ACCNUM"       "ALIAS"        "ENZYME"       "MAP"

##  [9] "PATH"         "PMID"         "REFSEQ"       "SYMBOL"

##  [13] "UNIGENE"      "ENSEMBL"      "ENSEMBLPROT"  "ENSEMBLTRANS"

##  [17] "GENENAME"     "UNIPROT"      "GO"           "EVIDENCE"

##  [21] "ONTOLOGY"     "GOALL"        "EVIDENCEALL"  "ONTOLOGYALL"

##  [25] "OMIM"         "UCSCKG"

然后，我们用select函数，就可以把任意公共数据库的数据进行一一对应了。

ensids <- c("ENSG00000130720", "ENSG00000103257", "ENSG00000156414",

"ENSG00000144644", "ENSG00000159307", "ENSG00000144485")

cols <- c("SYMBOL", "GENENAME")

select(org.Hs.eg.db, keys=ensids, columns=cols, keytype="ENSEMBL")

比如说，我们有几个ensembl的基因ID号。然后我们想找它所对应的gene名和缩略词简称，就通过select函数来搞定即可！

select(org.Hs.eg.db, keys="BRCA1", columns=c("ENSEMBL","UNIGENE","ENTREZID","CHR","GO","GENENAME"), keytype="SYMBOL")

这样得到了这个BRCA1基因的大部分信息，只是它的GO条目太多了，看得有点乱。