一眨眼，我们单细胞天地又持续输出了一年，但是我们团队毕竟不是科研服务公司，没有人付费养着我们做研发。所以现有团队时间和精力实在是有限，尤其是单细胞领域高速飞奔，CNS文章发表的速度远超我们能提供的详细解读速度！

我们团队收集整理了2G的单细胞文献PDF文件，但是各种云盘总是封杀这样的资源链接，我们也很难办。

所以呢，希望把这些文献分享给真正有需要的人。你只需要按照我们的文献领读要求，解读任意一篇单细胞相关文章，并且发邮件给我，就可以拿到全部的2G的单细胞文献PDF文件啦！

其实我们是想招募文献分享创作者啦，你懂的！

文献领读分享标准

首先必须要有文章发表于年份，杂志以及标题这样的开头

然后是摘要

使用哪种单细胞转录组技术，测下多少个样品，多少个细胞
重点发现是什么（细胞亚群，还是特殊通路）

正文5个重点

首先是样品，建库测序，RNA-seq上游分析概况

然后是质量控制情况，最后的表达矩阵是多少个基因多少个细胞

接着介绍作者是如何挑选重要的基因和降维

降维后的聚类以及对每个类的注释

类的下游分析(差异分析或者实验验证等)

最后总结一下

这个研究的发现了什么，意义是什么，点出它的特色。

我们收集的文献有

A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos.

• PMID：31830756
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
  

  Multi-omics profiling of mouse gastrulation at single-cell resolution.

• PMID：31827285
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Dec 11
  

  A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart.

• PMID：31835037
• 发表期刊：Cell.
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Dec 12
  

  Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia.

• PMID：31792411
• 发表期刊：Nat Biotechnol
• 影响因子：31.864
• 发表时间：2019 Dec 2
  

  Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma.

• PMID：31873309
• 发表期刊：Nat Med
• 影响因子：30.641
• 发表时间：2019 Dec 23
  

  Single cell transcriptome analysis reveals disease-defining T cell subsets in the tumor microenvironment of classic Hodgkin lymphoma.

• PMID：31857391
• 发表期刊：Cancer Discov
• 影响因子：26.37
• 发表时间：2019 Dec 19
  

  Loss of ADAMTS19 causes progressive non-syndromic heart valve disease.

• PMID：31844321
• 发表期刊：Nat Genet
• 影响因子：25.455
• 发表时间：2019 Dec 16
  

  CD4+ T Cell Help Is Required for the Formation of a Cytolytic CD8+ T Cell Subset that Protects against Chronic Infection and Cancer.

• PMID：31810883
• 发表期刊：Immunity
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Dec 17
  

  Hic1 Defines Quiescent Mesenchymal Progenitor Subpopulations with Distinct Functions and Fates in Skeletal Muscle Regeneration.

• PMID：31809738
• 发表期刊：Cell Stem Cell.
• 影响因子：21.464
• 发表时间：2019 Dec 5
  

  Design and application of single-cell RNA sequencing to study kidney immune cells in lupus nephritis.

• PMID：31853010
• 发表期刊：Nat Rev Nephrol
• 影响因子：19.684
• 发表时间：2019 Dec 18
  

  Using single-cell technologies to map the human immune system - implications for nephrology.

• PMID：31831877
• 发表期刊：Nat Rev Nephrol.
• 影响因子：19.684
• 发表时间：2019 Dec 12
  

  The power of one: advances in single-cell genomics in the kidney.

• PMID：31819231
• 发表期刊：Nat Rev Nephrol.
• 影响因子：19.684
• 发表时间：2019 Dec 9
  

  Genetic predisposition to mosaic Y chromosome loss in blood.

• PMID：31748747
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Nov 20
  

  In vitro culture of cynomolgus monkey embryos beyond early gastrulation.

• PMID：31672918
• 发表期刊：Science
• 影响因子：41.037
• 发表时间：2019 Nov 15
  

  Modeling the Evolution of Human Brain Development Using Organoids.

• PMID：31778651
• 发表期刊：Cell
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Nov 27
  

  B Cells and T Follicular Helper Cells Mediate Response to Checkpoint Inhibitors in High Mutation Burden Mouse Models of Breast Cancer.

• PMID：31730857
• 发表期刊：Cell
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Nov 14
  

  Clonal Decomposition and DNA Replication States Defined by Scaled Single-Cell Genome Sequencing.

• PMID：31730858
• 发表期刊：Cell
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Nov 14
  

  Genetic Identification of Vagal Sensory Neurons That Control Feeding

• PMID：31730854
• 发表期刊：Cell
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Nov 14
  

  Clonally Expanded T Cells Reveal Immunogenicity of Rhabdoid Tumors.

• PMID：31708437
• 发表期刊：Cancer Cell
• 影响因子：23.916
• 发表时间：2019 Nov 7
  

  Single-Cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thymic Lymphoid Progenitors and Thymus Organogenesis in Human Embryos

• PMID：31604687
• 发表期刊：Immunity
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Nov 19
  

  A single-cell atlas of entorhinal cortex from individuals with Alzheimer’s disease reveals cell-type-specific gene expression regulation.

• PMID：31768052
• 发表期刊：Nat Neurosci
• 影响因子：21.126
• 发表时间：2019 Nov 25
  

  Mapping microglia states in the human brain through the integration of high-dimensional techniques.

• PMID：31740814
• 发表期刊：Nat Neurosci
• 影响因子：21.126
• 发表时间：2019 Nov 18
  

  A Tppp3+Pdgfra+ tendon stem cell population contributes to regeneration and reveals a shared role for PDGF signalling in regeneration and fibrosis.

• PMID：31768046
• 发表期刊：Nat Cell Biol
• 影响因子：17.728
• 发表时间：2019 Nov 25
  

  Organoid single-cell genomic atlas uncovers human-specific features of brain development.

• PMID：31619793
• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Oct 16
  

  Dissecting primate early post-implantation development using long-term in vitro embryo culture.

• PMID：31672917
• 发表期刊：Science.
• 影响因子：41.037
• 发表时间：2019 Oct 31
  

  Spatiotemporal immune zonation of the human kidney.

• PMID：31604275
• 发表期刊：Science.
• 影响因子：41.037
• 发表时间：2019 Sep 27
  

  Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma.

• PMID：31675496
• 发表期刊：Cell.
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Oct 31
  

  Generation of Blastocyst-like Structures from Mouse Embryonic and Adult Cell Cultures.

• PMID：31626770
• 发表期刊：Cell.
• 影响因子：36.216
• 发表时间：2019 Oct 17
  

  Multimodal Analysis of Cell Types in a Hypothalamic Node Controlling Social Behavior.

• PMID：31626771
• 发表期刊：Cell.
• 影响因子：36.216
  

  Locally instructed CXCR4hi neutrophils trigger environment-driven allergic asthma through the release of neutrophil extracellular traps.

• PMID：31591573
• 发表期刊：Nat Immunol.
• 影响因子：23.53
• 发表时间：2019 Oct 7
  

  Single Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation.

• PMID：31661975
• 发表期刊：Circulation.
• 影响因子：23.054
• 发表时间：2019 Oct 30
  

  Transcriptional Atlas of Intestinal Immune Cells Reveals that Neuropeptide α-CGRP Modulates Group 2 Innate Lymphoid Cell Responses.

• PMID：31618654
• 发表期刊：Immunity.
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Oct 15
  

  TCF-1-Centered Transcriptional Network Drives an Effector versus Exhausted CD8 T Cell-Fate Decision.

• PMID：31606264
• 发表期刊：Immunity.
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Oct 7
  

  Single-Cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thymic Lymphoid Progenitors and Thymus Organogenesis in Human Embryos.

• PMID：31604687
• 发表期刊：Immunity.
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Oct 3
  

  In vivo CRISPR screening in CD8 T cells with AAV–Sleeping Beauty hybrid vectors identifies membrane targets for improving immunotherapy for glioblastoma

• PMID：31548728
• 发表期刊：Nat Biotechnol.
• 影响因子：31.864
• 发表时间：2019 Sep 23
  

  The phenotypes of proliferating glioblastoma cells reside on a single axis of variation.

• PMID：31554641
• 发表期刊：Cancer Discov.
• 影响因子：26.37
• 发表时间：2019 Sep 25
  

  Data denoising with transfer learning in single-cell transcriptomics.

• PMID：31471617
• 发表期刊：Nat Methods.
• 影响因子：28.467
  

  A pooled single-cell genetic screen identifies regulatory checkpoints in the continuum of the epithelial-to-mesenchymal transition.

• PMID：31477929
• 发表期刊：Nat Genet.
• 影响因子：25.455
  

  Activation of Hedgehog Signaling Promotes Development of Mouse and Human Enteric Neural Crest Cells, Based on single-cell Transcriptome Analyses.

• PMID：31442438
• 发表期刊：Gastroenterology.
• 影响因子：19.233
• 发表时间：2019 Aug 20
  

  Interleukin 1 beta and Matrix Metallopeptidase 3 Contribute to Development of EGFR-dependent Serrated Polyps in Mouse Cecum

• PMID：31470007
• 发表期刊：Gastroenterology.
• 影响因子：19.233
• 发表时间：2019 Aug 27
  

  Single-cell transcriptional analyses of spasmolytic polypeptide-expressing metaplasia arising from acute drug injury and chronic inflammation in the stomach.

• PMID：31481545
• 发表期刊：Gut.
• 影响因子：17.943
• 发表时间：2019 Sep 3
  

  A large pool of actively cycling progenitors orchestrates self-renewal and injury repair of an ectodermal appendage.

• PMID：31481792
• 发表期刊：Nat Cell Biol
• 影响因子：17.728
• 发表时间：2019 Sep
  

  Diversification and CXCR4-Dependent Establishment of the Bone Marrow B-1a Cell Pool Governs Atheroprotective IgM Production Linked To Human Coronary Atherosclerosis

• PMID：31549940
• 发表期刊：Circ Res.
• 影响因子：15.862.
  

  Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human implantation

• PMID：31435013
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Aug 21
  

  Conserved cell types with divergent features in human versus mouse cortex

• PMID：31435019
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Aug 21
  

  Locally renewing resident synovial macrophages provide a protective barrier for the joint

• PMID：31391580
• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• 发表时间：2019 Aug 07
  

  Clonal replacement of tumor-specific T cells following PD-1 blockade

• PMID：31359002
• 发表期刊：Nat Med
• 影响因子：30.641
  

  Atheroprotective roles of smooth muscle cell phenotypic modulation and the TCF21 disease gene as revealed by single-cell analysis

• PMID：31359001
• 发表期刊：Nat Med
• 影响因子：30.641
• 发表时间：2019 Jul 29
  

  Molecular mechanisms of lineage decisions in metabolite-specific T cells.

• PMID：31431722
• 发表期刊：Nat Immunol.
• 影响因子：23.53
• 发表时间：2019 Aug 20
  

  An Nfil3-Zeb2-Id2 pathway imposes Irf8 enhancer switching during cDC1 development

• PMID：31406377
• 发表期刊：Nat Immunol
• 影响因子：23.53
• 发表时间：2019 Aug 12
  

  Single-Cell Survey of Human Lymphatics Unveils Marked Endothelial Cell Heterogeneity and Mechanisms of Homing for Neutrophils

• PMID：31402260
• 发表期刊：Immunity
• 影响因子：21.522
• 发表时间：2019 Aug 01
  

  Defining the Identity and Dynamics of Adult Gastric Isthmus Stem Cells

• PMID：31422913
• 发表期刊：Cell Stem Cell
• 影响因子：21.464
• 发表时间：2019 Aug 08
  

  Single-cell analysis of cardiogenesis reveals basis for organ-level developmental defects.

• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• PMID：31341279
• 发表时间：2019 Jul 24
  

  RNA sequencing: the teenage years.

• 发表期刊：Nat Rev Genet.
• 影响因子：43.07
• PMID：31341269
• 发表时间：2019 Jul 24
  

  Neuronal vulnerability and multilineage diversity in multiple sclerosis.

• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• PMID：31316211
• 发表时间：2019 Jul 17
  

  A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors.

• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• PMID：31292543
• 发表时间：2019 Jul 10
  

  scSLAM-seq reveals core features of transcription dynamics in single cells.

• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• PMID：31292545
• 发表时间：2019 Jul 10
  

  Single-cell analysis reveals T cell infiltration in old neurogenic niches.

• 发表期刊：Nature.
• 影响因子：43.07
• PMID：31270459
• 发表时间：2019 Jul 03
  

  Neutrophils Driving Unconventional T Cells Mediate Resistance against Murine Sarcomas and Selected Human Tumors.

• 发表期刊：Cell.
• 影响因子：36.216
• PMID：31257026
• 发表时间：2019 Jul 11
  

  An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma.

• 发表期刊：Cell
• 影响因子：36.216
• PMID：31327527
• 发表时间：2019 Jul 9
  

  Epigenomics and Single-cell Sequencing Define a Developmental Hierarchy in Langerhans Cell Histiocytosis.

• 发表期刊：Cancer Discov.
• 影响因子：26.37
• PMID：31345789
• 发表时间：2019 Jul 25
  

  Generation of Human PSC-Derived Kidney Organoids with Patterned Nephron Segments and a De Novo Vascular Network.

• 发表期刊：Cell Stem Cell.
• 影响因子：21.464
• PMID：31303547
  

  Cellular crosstalk in the development and regeneration of the respiratory system

• 发表期刊：NAT Rev Mol cell Biol
• 影响因子：43.351
• PMID：31217577
• 发表时间：2019 Jun 19
  

  Individual brain organoids reproducibly form cell diversity of the human cerebral cortex

• 发表期刊：Nature
• 影响因子：43.07
• PMID：31168097
• 发表时间：2019 Jun 05
  

  Obesity remodels activity and transcriptional state of a lateral hypothalamic brake on feeding

• 发表期刊：Science
• 影响因子：41.037
• PMID：31249056
• 发表时间：2019 Jun 28
  

  Cross-species single-cell analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma reveals antigen-presenting cancer-associated fibroblasts

• 发表期刊：Cancer Discov
• 影响因子：26.37
• PMID：31197017
• 发表时间：2019 Jun 13
  

  The immune cell landscape in kidneys of patients with lupus nephritis

• 发表期刊：Nat Immunol
• 影响因子：23.53
• PMID：31209404
• 发表时间：2019 Jun 17
  

  Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing

• 发表期刊：Eur Heart J
• 影响因子：23.239
• PMID：31242503
• 发表时间：2019 Jun 26
  

  Single Cell Analysis of the Normal Mouse Aorta Reveals Functionally Distinct Endothelial Cell Populations

• 发表期刊：Circulation
• 影响因子：23.054
• PMID：31146585
• 发表时间：2019 May 31
  

  Single-Cell RNA Sequencing of the T Helper Cell Response to House Dust Mites Defines a Distinct Gene Expression Signature in Airway Th2 Cells

• 发表期刊：Immunity
• 影响因子：21.522
• PMID：31231035
• 发表时间：2019 Jun 14
  

  Sensory lesioning induces microglial synapse elimination via ADAM10 and fractalkine signaling.

• 发表期刊：Nat Neurosci
• 影响因子：21.126
• PMID：31209379
• 发表时间：2019 Jun 17
  

  Single-cell genomics identifies cell type-specific molecular changes in autism.

• PMID：31097668
• 发表期刊：Science
• 影响因子：41.058
• 发表时间： 2019-5-17
  

  Identification of a regeneration-organizing cell in the Xenopus tail.

• PMID：31097661
• 发表期刊：Science
• 影响因子：41.058
• 发表时间：2019-5-17
  

  Temporal patterning of apical progenitors and their daughter neurons in the developing neocortex.

• PMID：31073041
• 发表期刊：Science
• 影响因子：41.058
• 发表时间：2019-5-10
  

  A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia.

• PMID：31130381
• 发表期刊：Cell
• 影响因子：31.398
• 发表时间：2019-5-23
  

  Adaptive Immune Resistance Emerges from Tumor-Initiating Stem Cells

• PMID：31031009
• 发表期刊：cell
• 影响因子：31.398
• 发表时间：2019-4-25
  

  Mechanisms of lymphoma clearance induced by high-dose alkylating agents

• PMID： 31040105
• 发表期刊：Cancer discovery
• 影响因子：24.373
• 发表时间：2019-4-30
  

  Single-Cell Analysis of the Liver Epithelium Reveals Dynamic Heterogeneity and an Essential Role for YAP in Homeostasis and Regeneration.

• PMID：31080134
• 发表期刊：Cell Stem Cell
• 影响因子：23.29
• 发表时间：2019-5-1
  

  YAP, but Not RSPO-LGR4/5, Signaling in Biliary Epithelial Cells Promotes a Ductular Reaction in Response to Liver Injury.

• PMID：31080135
• 发表期刊：Cell Stem Cell
• 影响因子：23.29
• 发表时间：2019-5-7
  

  Defining inflammatory cell states in rheumatoid arthritis joint synovial tissues by integrating single-cell transcriptomics and mass cytometry.

• PMID：31061532
• 发表期刊：nature immunology
• 影响因子：21.809
• 发表时间：2019-5-6
  

  A single-cell atlas of mouse brain macrophages reveals unique transcriptional identities shaped by ontogeny and tissue environment.

• PMID：31061494
• 发表期刊：nature neuroscience
• 影响因子：19.912
• 发表时间：2019-5-6
  

  HBEGF+ macrophages in rheumatoid arthritis induce fibroblast invasiveness.

• PMID：31068444
• 发表期刊：SCI Transl Med
• 影响因子：16.71
• 发表时间：2019-5-8