全网第一个单细胞课程陆陆续续运营两年了，基本上大家目前看到的市面上的公司或者培训机构的单细胞相关培训材料，讲师，都是看我们的教材慢慢出师的。期间我们进行了两次预售：
本课程售价499元，三个月的预售期间价格为299元（使用优惠码为2d42ee），10多个小时的视频教程
- 手机微信观看（推荐）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53
- 电脑浏览器的链接： http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
带领了近千人一起复现了一篇单细胞转录组文章的全部图表，从fastq测序数据处理，比对到表达矩阵的生成，从细胞的降维和分群到每个群细胞的功能注释，最后到公共数据库的注释，生存分析看不同细胞亚群的临床意义。
加微信咨询烦不胜烦
本来嘛，当初预售放自己的微信二维码是想听一下大家的课程反馈，根据大家的反馈来改进视频，后来自己太忙了，其实也不会把视频课程当做是主业，所谓的改进也无从谈起。而且现在加我微信收费是500，已经比课程要贵了，这是一个亏本买卖，所以公开声明一下，大家不要再添加我微信来购买这个全网第一个单细胞课程，我不卖了。
首先学习单细胞课程是有门槛的
通常是告诉学员，需要有linux和r基础：
知识点路线图如下：
了解常量和变量概念
加减乘除等运算（计算器）
多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）
多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）
文件读取和写出
简单统计可视化
无限量函数学习
建议结合书籍多练习！
然后我们的单细胞已经有完整文字版教程了
所以你其实可以不需要购买视频了，除非你对我的声音有特殊的爱好，或者其他我不知道的原因：
第一单元：文献背景及课程介绍
第二单元：常规转录组基础知识回顾
- （五）常说的表达矩阵，那得到之后呢？
- （六）由表达矩阵看内部异质性
- （七）重复平均表达量和变异系数相关性散点图
- （八）聚类算法之PCA与tSNE
- （九）统计细胞检测的基因数量
- （十）乳腺癌领域之PAM50分类
- （十一）生物学背景知识之细胞周期推断
- （十二）RPKM概念及计算方法
- （十三）差异分析及KEGG注释简介
第三单元：单细胞3大R包的学习
- （十四）学习scRNAseq这个R包
- （十五）利用scRNAseq包学习scater
- （十六）用Scater包分析文章数据
- （十七）用Seurat包分析文章数据（二）
- （十八）scRNA包学习Monocle2
- （十九）使用monocle2分析文章数据
第四单元：重复文章图表
第五单元：结合公共数据库
总结起来就是走单细胞下游分析标准流程啊，就是那些R包的认知，包括 scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop 需要熟练掌握它们的对象，：一些单细胞转录组R包的对象 ，分析流程也大同小异：
- step1: 创建对象
- step2: 质量控制
- step3: 表达量的标准化和归一化
- step4: 去除干扰因素(多个样本整合)
- step5: 判断重要的基因
- step6: 多种降维算法
- step7: 可视化降维结果
- step8: 多种聚类算法
- step9: 聚类后找每个细胞亚群的标志基因
- step10: 继续分类
如果是10X的单细胞转录组数据
大家都知道，目前单细胞是10x的天下，而10x的测序数据，御用软件cellranger其实就是star的包装，关于10X仪器的单细胞转录组数据走cellranger流程，我们在单细胞天地多次分享过流程笔记，大家可以自行前往学习，如下：
- 单细胞实战(一)数据下载
- 单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项
- 单细胞实战(三) Cell Ranger使用初探
- 单细胞实战(四) Cell Ranger流程概览
- 单细胞实战(五) 理解cellranger count的结果
你可以做的更好！