生信技能树论坛-研究热点版块介绍(一)

三代测序、化学信息学
免疫研究、GWAS
Meta分析、单细胞测序
进化分析、机器学习
今天我们将对论坛研究热点版块进行介绍,本文是第一篇,讲的是开篇提到的这几个热点。如果你很感兴趣,请不要错过下文这些精彩的内容哦。若你想分享自己的学习资源和学习心得,欢迎你在对应的区域发帖,帮助更多对这部分内容感兴趣的人。
【真诚欢迎你】我们很多版块都需要补充和完善,如果你愿意加入我们一起建设论坛,我们非常欢迎,相信这个过程你一定能收获很多,快到碗里来吧,有能力有担当的朋友请与我们联系。:)
(2017.12.15)

化学信息学

化学信息学第一篇

Meta分析

【原创】循证之路-meta分析入门培训
Meta分析第一步收集数据咯
ADDIS制作meta网状分析教程

机器学习

机器学习入门打卡贴
R包:caret做机器学习-特别方便
一些常用的machine learning R packages和简单介绍

单细胞测序

有关Drop-Seq技术的一篇报道
Single Cell Sequencing
单细胞测序聚类发现新类型细胞
单细胞测序分析工具SC3文章图片绘制

三代测序

三代全长转录组测序
三代测序建库-1
三代测序建库-2 : Template preparation workflow
双十一围观剁手才是正经事-三代测序剁手篇
大型基因组拼装的乐高软件之MaSuRCA assembler使用指南
转载: “远见还是痴念?三代测序和它的时代特点”
PacBio sequence error correction amd assemble via pacBioToCA

免疫研究

第一篇
【免疫组测序-1】免疫组测序背景介绍(免疫组库)
【免疫组测序-2】免疫组测序背景介绍(免疫组库)
【免疫组测序-插播】neoantigen重要临床数据《nature》
免疫组库重新学一下
免疫组库测序的研究对象、扩增方法以及平台选择
免疫组库在疾病研究中几个应用
个性化免疫疗法与免疫组测序的结合(综述)

进化分析

群体进化分析入门必名词解释
肿瘤异质性/克隆分析
根据突变数据构建进化树
根据距离矩阵构建进化树
系统进化树构建的不简单实战
进化转录组流程
手把手教你怎么做一个简单的系统发育分析
使用ParaAT和kaks_calculator批量Kaks批量计算
在线分析工具-你值得拥有

GWAS

GWAS研究现状及资源下载
GWAS中如何计算BLUP
GWAS研究麻风病
2016-GWAS综述-Concepts and relevance of genome-wide association studies
用23andMe公司的89,283客户的基因型数据做GWAS
R直接读取plink格式的BED/BIM/FAM文件
关于ped和map文件
Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因组复杂性状分析
利用GCTA工具计算复杂性状/特征(Complex Trait)的遗传相关性
高通量测序数据的多位点GWAS和多QTL作图应用技术
绘图时稀释SNP的策略分享
如何使用CMplot绘制曼哈顿图
如何轻松绘制表型性状数据分布图
如何在GWAS之前过滤SNP
使用GCTA计算PCA,GMR及GWAS
使用Admixture计算群体结构
fastSTRUCTURE,简单快速进行群体结构分析

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