文献阅读笔记-2013-H3K27me3 and K27M mutation

这篇文章是Received 29 March 2013, Revised 9 August 2013, Accepted 4 October 2013, Available online 31 October 2013

同时还有17 MAY 2013一篇science文章提到了K27M mutant影响了PRC2活性

we performed IHC for H3K27me3 in a large cohort of pHGGs with known H3F3A mutation status (n = 104).

Strikingly, all K27M mutant pHGGs (n = 21) showed a strong reduction of overall H3K27me3 levels.

这篇文章就这一个目的,抢这个热点。

这篇文章的数据只有表达芯片数据可以下载了!

又增加了22个表达芯片数据!

Microarray expression data of 22 tumor samples are available in National Center for Biotechnology Information’s Gene Expression Omnibus (GEO; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo) through GEO Series accession numbers GSE36245GSE34824, and GSE49822.

H3K27me3 ChIP-Seq and WGBS data are available through European Genome-phenome Archive accession number EGAS00001000578. 这些数据需要申请才能下载,我就不多说了!

我们知道H3蛋白是由多个基因编码的,而H3F3A这个基因的K27M突变居然使得细胞整体的H3K27me3水平下降,简直不可思议。

因为H3F3A这个基因翻译的H3蛋白只是占了细胞H3蛋白的极少比例,虽然H3F3A这个基因的K27M突变肯定使得它自己的H3K27me3不能成功,但是它为什么能影响其它H3蛋白,的确是非常奇怪的事情。

所以非常值得探究。但是作者只是介绍了这个发现而已。并没有深入探究。

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