用excel表格做差异分析

其实主要要讲的不是用excel来做差异分析,只是想讲清楚差异分析的原理,用excel可视化的操作可能会更方便理解,而且想告诉大家,其实生物信息学分析,本来就很简单的,那么多软件,只有你理解了原理,你自己就能写出来的!

首先,还是得到表达矩阵,下面绿色的样本是NASH组,蓝色的样本是normal组

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我们进行差异分析,很简单,就是看两组的表达值,是否差异,而检验的方法就是T检验。

=AVERAGE(D2:L2)    ##求NASH组的平均表达量

=AVERAGE(M2:S2)    ###求normal的平均表达量

=T2-U2             ##计算得到logFOLDchange值

=AVERAGE(D2:S2)    ###得到所有样本的平均表达量

=T.TEST(D2:L2,M2:T2,2,3)  ###用T检验得到两个组的表达量的差异显著程度。

简单检查几个值就可以看到跟limma包得到的结果差不多。

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