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scalpel软件找indel

Scalpel is available here: http://scalpel.sourceforge.net/
文章是: http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n10/full/nmeth.3069.html
很赞的工具!
软件说明书写的也比较详细:http://scalpel.sourceforge.net/manual.html
他提供了3种情况的找INDELs变异,我目前需要用的就是对我的全基因组测序数据来找,所以用single模式:
为了节省对计算资源的消耗,作者建议我单独对每条染色体分别处理。 Continue reading