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Bioconductor包chimeraviz嵌合RNA可视化

Bioconductor包chimeraviz嵌合RNA可视化

高通量RNA测序已经能够更高效地检测融合转录本,但是融合检测的技术和相关软件通常产生高错误发现率。而一个自动整合RNA数据和已知基因组特征的可视化框架对于结果的检验是有帮助的。2017年发布的一个bioconductor包,chimeraviz就可以做到自动创建嵌合RNA可视化。

支持来自9种不同融合发现工具(deFuseEricScript、InFusion、JAFFA、FusionCatcher、FusionMap、PRADA、SOAPfuse和STAR-FUSION)的输入。 Continue reading