我前面写到了生信分析人员如何入门linux和perl，后面还会写R和python的总结，但是在这中间我想插入一个脚本实战指南。其实在我前两篇日志里面也重点提到了学习编程语言最重要的就是实战了，也点出了几个关键词。在实际生物信息学数据处理中应用perl和linux，可以借鉴EMBOSS软件套件，fastx-toolkit等基础软件，实现并且模仿该软件的功能。尤其是SMS2/exonerate/里面的一些常见功能,还有DNA2.0 Bioinformatics Toolbox的一些工具。如果你这些名词不懂，请赶快谷歌！！！ 它们做了什么，输入文件是什么，输出文件是什么，你都可以用脚本实现！

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