我们当然不至于只有转录组啊

前些天有一个人给了我这样的留言,让我我现在很迷茫:

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这个人已经是四五年的老粉了,确实,如果他一路看过来,很容易发现我们其实一直是三板斧(编程基础+ngs多组学+单细胞)。很单调,是有点乏善可陈,但是我个人确实是感觉写什么都很难突破过去的自己,这个公众号创作是越来越搞不下去了。。。。

虽然说我们偶尔也有一些其它专题,比如流式细胞仪数据处理:

以及表观调控领域最经典的甲基化芯片数据处理:

也有些临床数据挖掘实践,比如泛癌数据分析:

也是有一些小众数据挖掘,比如免疫组库:

还有肿瘤相关的DNA测序数据分析,比如肿瘤外显子的:

但是这样的笔记无论是从质的角度还是量的角度,都没办法撑得起来一个生物信息学领域论坛(生信技能树),仅仅是我个人的学习经历的笔记合辑。

而我一个人的创作就必然会陷入“舒适区”怪圈,即使是强迫自己去不停地学习各种技术做整理,反而是耽误了自己的成长,总不能说一直就学习学习基础吧。这条路我五年前已经是走过一次了:


学徒第1月,基础知识介绍掌握 https://www.mubu.com/doc/38tEycfrQg
学徒第2月,RNA-seq数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/38y7pmgzLg
学徒第3月,WES数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/1iDucLlG5g
学徒第4月-01-ChIP-seq数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/11taEb9ZYg
学徒第4月-02-ATAC-seq数据处理实战 https://www.mubu.com/doc/2DG1mC2kdg
学徒第4月-03-表观调控(RNA-seq和ChIP-seq的联合分析) https://www.mubu.com/doc/3Bd4aieYug
学徒第5月-01-甲基化芯片(450K或者850K)数据处理 https://www.mubu.com/doc/1cwlFgcXMg
学徒第5月-02-LncRNA实战 https://www.mubu.com/doc/ISk-Ev1tg
学徒第5月-03-miRNA-seq实战演练 https://www.mubu.com/doc/7A3T8hpUlLv

现在难道是还得逼着自己再来一次吗?

未来的生物信息学知识点整理的路该如何走?如何才能号召更多人,或者说如何更好的组织有志之士参与协作整理呢?

01-生物信息学绘图大全 https://www.mubu.com/doc/3L0wkgGUVg
02-跟着bioconductor包学生物信息学 https://www.mubu.com/doc/1WKFG-171g
03-生物信息学必知必会 https://www.mubu.com/doc/3i-F76DfYg
04-转录组笔记推文任务列表(半年期) https://www.mubu.com/doc/14uneHKvPg
04-转录组下游分析知识点面面俱到 https://www.mubu.com/doc/3pRgWLU5Lg

算起来,我都做了快十年了,如果说十年间一直在把这三板斧(编程基础+ngs多组学+单细胞)反复咀嚼,确实是说不过去:


01-TCGA数据挖掘文献整理 https://www.mubu.com/doc/36AU00FIxWf
02-GTEx和ENCODE等大型国际NGS计划文献整理 https://www.mubu.com/doc/5D5dC7Fep7f
03-转录组2023马拉松授课大纲 https://www.mubu.com/doc/47d_2fEmcqv
04-数据挖掘本科毕业设计辅导 https://www.mubu.com/doc/1L99bY0csg
05-单细胞初识(生信技能树+单细胞天地) https://www.mubu.com/doc/3347KRIo18v

单细胞数据一站式分析平台的开发及推广 https://www.mubu.com/doc/2RYc4vgN2R_
临床数据挖掘36计 https://www.mubu.com/doc/7vQl-BKxSbv 
生物信息学百款软件 https://www.mubu.com/doc/nMIuO1vG5_

亲爱的读者朋友们,大家有什么好的建议吗?

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