格拉斯哥大学为期两周的生物信息学暑期培训

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在朋友圈看到这个夏令营的时候它就结束了，还蛮有意思的：

Week 1 (Linux, R, Mapping, SNP's, RNA-Seq, single-cell)
Monday 21/08/2023 - Friday 25/08/2023.

Week 2 (bioinformatics of advanced single-cell transcriptomic)
Monday 28/08/2023 - Friday 01/09/2023

费用不便宜哦：

Two weeks: £1200 for academics / £1800 commercial
One week: £750 for academics / £1200 commercial

格拉斯哥大学（University of Glasgow）是苏格兰格拉斯哥市的一所历史悠久的著名大学，成立于1451年，是英国最古老的大学之一。它位于格拉斯哥市中心，拥有悠久的历史和卓越的学术声誉。

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可以看到学习内容跟我们五年前的学徒培养计划基本上高度重合啦，区别就是最近五年更新了单细胞相关内容：

First week (Bioinformatics of next generation sequencing):

  • Basics of Linux
  • Introduction to R
  • Introduction to next-generation sequencing
  • Data visualization
  • SNP analysis
  • Transcriptomics: bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
  • De novo assembly (new - alternative track to scRNA-Seq)
  • Databases
  • Data processing

Second week (advanced single cell)

  • Basic understanding of single cell analysis methods
  • Advanced R
  • Integration of scRNA
  • Pseudo time
  • Cell-cell communication
  • Spatial transcriptomic
  • Integration of scRNA-Seq data
  • Tipps and tricks

我们五年前的学徒培养计划如下所示：

01-学徒任务板 https://www.mubu.com/doc/1TAhd6KHPg
03-线上3个月学徒培养计划（以3个月为期限） https://www.mubu.com/doc/3TW_2GbfTg
04-多种学徒培养方案 文档链接: https://www.mubu.com/doc/1mIVPlpvPg 密码: 6c3d

学徒第1月，基础知识介绍掌握 https://www.mubu.com/doc/38tEycfrQg
学徒第2月，RNA-seq数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/38y7pmgzLg
学徒第3月，WES数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/1iDucLlG5g
学徒第4月-01-ChIP-seq数据分析实战训练 https://www.mubu.com/doc/11taEb9ZYg
学徒第4月-02-ATAC-seq数据处理实战 https://www.mubu.com/doc/2DG1mC2kdg
学徒第4月-03-表观调控（RNA-seq和ChIP-seq的联合分析） https://www.mubu.com/doc/3Bd4aieYug
学徒第5月-01-甲基化芯片（450K或者850K）数据处理 https://www.mubu.com/doc/1cwlFgcXMg
学徒第5月-02-LncRNA实战 https://www.mubu.com/doc/ISk-Ev1tg
学徒第5月-03-miRNA-seq实战演练 https://www.mubu.com/doc/7A3T8hpUlLv

但是因为我们的学徒培养方案里面的单细胞内容太少了，已经是很难吸引到小伙伴加入了，说实话，有一点遗憾。绝大部分小伙伴都比较纯粹就是想学一学热点，比如空间单细胞，单细胞多组学，并不想踏踏实实从零开始，我也很发愁。

空间单细胞，单细胞多组学

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