前面我们分享了 你还缺乳腺癌表达量数据集吗，里面有34个数据集，然后热心的粉丝赶快留言了另外一个包：MetaGxBreast ，里面的数据集更多。同样的也值得介绍

安装和加载MetaGxBreast相信已经无需我多说了：

BiocManager::install('MetaGxBreast') 
library("MetaGxBreast")

这个包MetaGxBreast整理好的数据集超级多：

# 代号，具体数据集描述如下
CAL CAL
DFHCC DFHCC
DFHCC2 DFHCC2
DFHCC3 DFHCC3
DUKE DUKE
DUKE2 DUKE2
dupplicates a list containing the names of patients that are believed to be dulicates across datasets
EMC2 EMC2
EORTC10994 EORTC10994
EXPO EXPO
FNCLCC FNCLCC
GSE25066 GSE25066
GSE32646 GSE32646
GSE48091 GSE48091
GSE58644 GSE58644
HLP HLP
IRB IRB
KOO KOO
loadBreastDatasets Function to load breast cancer SummarizedExperiment objectsfrom the Experiment Hub
loadBreastEsets Function to load breast cancer expression sets from the Experiment Hub
LUND LUND
LUND2 LUND2
MAINZ MAINZ
MAQC2 MAQC2
MCCC MCCC
MDA4 MDA4
METABRIC METABRIC
MSK MSK
MUG MUG
NCCS NCCS
NCI NCI
NKI NKI
PNC PNC
STK STK
STNO2 STNO2
TCGA TCGA
TRANSBIG TRANSBIG
UCSF UCSF
UNC4 UNC4
UNT UNT
UPP UPP
VDX VDX

使用 loadBreastEsets 函数实时下载

可以一次性下载多个数据集，得到一个列表

 esets = MetaGxBreast::loadBreastEsets(loadString = c("CAL", "DFHCC", "DFHCC2", "DFHCC3", "DUKE", "DUKE2", "EMC2"))[[1]]

这个 esets列表的每个元素都是一个 独立的ExpressionSet对象，后面可以做个性化分析。