突变全景图不会优化,看看CoMutPlotter

CoMutPlotter这个网页工具与2019年7月发表在 BMC Medical Genomics 杂志,文章标题是;《CoMutPlotter: a web tool for visual summary of mutations in cancer cohorts》选自第八届转化生物信息学会议: 医学基因组学,研究者是台湾长庚大学的。

我以前介绍过他们团队的台湾口腔癌多组学队列研究。详见:台湾OSCC癌症多组学| 生信菜鸟团,2016年10月年发表在NC:APOBEC3A is an oral cancer prognostic biomarker in Taiwanese carriers of an APOBEC deletion polymorphism,我相信他们也应该是踩了很多坑,才决心制作一个网页工具吧!

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参考:http://tardis.cgu.edu.tw/comutplotter/comutplotter_tutorial/

值得一提的是:他们使用 bookdown 来制作网页工具文档的思路很棒,值得学习!

1 Introduction
2 Implementation
 2.1 CoMutPlotter Framework
 2.2 Data Input
 2.3 Visualization and web modules
 2.4 OUTPUT
3 Example of Use
 3.1 Upload mutation profile
 3.2 Output of CoMutPlotter
 3.3 Cross-project comparison
 3.4 Download & Report Generation
Published with bookdown

点击文末阅读原文就可以直达网页工具文档哦!

关于突变全景图的知识点,大家可以看我在《生信技能树》的教程啦,如果你目前看教程比较困难,有一个学习班推荐给大家!

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