咱们生信菜鸟团的周一专栏经历了《学徒数据挖掘》以及《肿瘤外显子》两个话题，目前也在逐渐过渡到《生信工作咨询》，后台的粉丝一直在呼唤前面两个话题的回归。不得不说，非常难，坚持写笔记这件事呢并不是在写，而是在坚持，在生信知识整理和分享这个领域，我算是一个老兵了，现在其实也有一些乏力。
好在这些年也是在不停的培养实习生和学徒，负责《学徒数据挖掘》专栏的璐璐是天赋和悟性最好的，可惜待了就一年就走了，不过人各有志吧，强扭的瓜不甜。负责《肿瘤外显子》专栏的小郭是最踏实的，所以坚持了两年，但是我这边已经没有可以让他高速成长的环境了，所以忍痛送人了，希望他在新单位爆发式成长。
《肿瘤外显子》专栏的目录（节选）如下：
- （一）读文献并且下载测序数据
- （二）质控与去接头
- （三）比对
- （四）比对结果的质控
- （番外篇）bam文件载入igv可视化
- （五）GATK的最佳实践
- （六）vcf文件的注释及ANNOVAR的使用
- （七）maftools可视化
- （八）不同注释软件的比较（上）：安装及使用
- （八）不同注释软件的比较（中）：注释后转成maf文件
- （八）不同注释软件的比较（下）：可视化比较maf文件
很难再有机缘巧合可以让一个人专注于学习一个领域传达2年了，也很难找到如此身心契合的学生了，如果你有兴趣加入我们，可以看看：生信技能树知识整理实习生招募，长期招募。作者原话如下
因为个人精力有限，系列教程不得不先暂告一段落。后续会不定时更新，可能一个月更新一篇，而且主要以肿瘤外显子相关文章的解读或者图表重现为主，不再更新技术类教程。
系列教程就当做是抛砖引玉，更多的分析方法、更多的技术开发，留给后浪们去探索。
读者可以在专辑中查看系列教程的所有篇章，也可以到生信技能树的语雀知识库：https://www.yuque.com/biotrainee/wes 阅读，后者体验更加，且会不定时更正教程上的错漏，也欢迎读者可以在语雀知识库评论区指出教程上不恰当的地方。
正如我之前所说的，原本肿瘤外显子系列教程，只是我的实战笔记，但是在整理笔记的过程中，发现对数据、代码、生物学等知识都有了更加深入的理解。在数据分析过程中，也遇到了很多问题、各种报错等，需要通过不断的搜索来解决，debug 的过程是非常耗费时间和精力的，但却是我提升的最关键一步。在完成该数据分析的过程中，我还发现，网上很多教程，往往只记录了某一步骤或者某一软件的使用方法，没公开数据分析的前后流程。因此希望通过本教程，为读者提供一个参考，尽可能降低学习的门槛，更加便捷地完成自己的数据分析。
如果本系列教程对你的科研上确实有帮助，希望可以在文章的最后加上一个致谢：We thank Dr.Jianming Zeng(University of Macau), and all the members of his bioinformatics team, biotrainee, for generously sharing their experience and codes.
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