有学员提问：

请教老师，在分析一个芯片数据时候，遇到这个GPL16686平台，直接看平台信息里面的表格如图，找不到基因名，所以不知道该怎么办，ID转换就卡死了，后续的差异分析，火山图，热图等等都无从下手。

如下所示：

但，其实这个表格已经是给出来了基因名字，就是 GB_ACC 那一列的内容，属于refseq数据库的ID系列。这个GPL16686平台芯片的难点并不在ID转换，基因注释，反而是在上游处理，质量控制等等，我在：HTA芯片（学徒探索任务） 指出过这一点。

那，为什么大家普遍的问题都集中在ID转换呢，主要是因为大家处于生物信息学初学者这个环节，没办法看到GB_ACC就里面反映过来它是refseq数据库的ID，如果大家注意留意我们生信技能树的基础知识大全，比如24.使用R语言获取人类所有基因的名字，ID，symbol以及别名 就可以看到相应的数据库资源了。 entrez gene ID, HUGO symbol, refseq ID, ensembl ID 这些专有名词，我们也是在生信菜鸟团安排专门的小编整理了这些知识：生信基础知识100讲 。

library(org.Hs.eg.db)
ls('package:org.Hs.eg.db')

在R里面可以看到这个 org.Hs.eg.db包其实 把大家数据分析过程中用得上的ID都整理好了：

> ls('package:org.Hs.eg.db')
 [1] "org.Hs.eg" "org.Hs.eg_dbconn" "org.Hs.eg_dbfile" 
 [4] "org.Hs.eg_dbInfo" "org.Hs.eg_dbschema" "org.Hs.eg.db" 
 [7] "org.Hs.egACCNUM" "org.Hs.egACCNUM2EG" "org.Hs.egALIAS2EG" 
[10] "org.Hs.egCHR" "org.Hs.egCHRLENGTHS" "org.Hs.egCHRLOC" 
[13] "org.Hs.egCHRLOCEND" "org.Hs.egENSEMBL" "org.Hs.egENSEMBL2EG" 
[16] "org.Hs.egENSEMBLPROT" "org.Hs.egENSEMBLPROT2EG" "org.Hs.egENSEMBLTRANS" 
[19] "org.Hs.egENSEMBLTRANS2EG" "org.Hs.egENZYME" "org.Hs.egENZYME2EG" 
[22] "org.Hs.egGENENAME" "org.Hs.egGO" "org.Hs.egGO2ALLEGS" 
[25] "org.Hs.egGO2EG" "org.Hs.egMAP" "org.Hs.egMAP2EG" 
[28] "org.Hs.egMAPCOUNTS" "org.Hs.egOMIM" "org.Hs.egOMIM2EG" 
[31] "org.Hs.egORGANISM" "org.Hs.egPATH" "org.Hs.egPATH2EG" 
[34] "org.Hs.egPFAM" "org.Hs.egPMID" "org.Hs.egPMID2EG" 
[37] "org.Hs.egPROSITE" "org.Hs.egREFSEQ" "org.Hs.egREFSEQ2EG" 
[40] "org.Hs.egSYMBOL" "org.Hs.egSYMBOL2EG" "org.Hs.egUCSCKG" 
[43] "org.Hs.egUNIGENE" "org.Hs.egUNIGENE2EG" "org.Hs.egUNIPROT" 
>

当然了，有背景知识，还需要一些代码技巧，才能做好ID转换， 主要是 match函数，%in% 函数，merge函数的使用！

感兴趣这些ID转换的小伙伴，可以参加我们这个月18号(下周六晚上)八点的钉钉群公开课，带你一次性弄清楚无穷多的ID转换问题。我们的讲师会带领大家系统性整理生信技能树过去几年关于ID转换的经验合辑，视频+习题，让你一次性学个够！

• 1.拟南芥的基因ID批量转换？差异基因，GO/KEGG数据库注释（转录组直接送你全套流程）
• 2.第一个万能芯片探针ID注释平台R包
• 3.第二个万能芯片探针ID注释平台R包
• 4.第三个万能芯片探针ID注释平台R包
• 5.基因类型注释根据基因ID就好了
• 6.芯片探针ID的基因注释以前很麻烦
• 7.TCGA ID 转化的小插曲
• 8.ID转换大全
• 9.下载所有芯片探针序列并且写成fasta文件
• 10.（重磅！价值一千元的R代码送给你）芯片探针序列的基因组注释
• 11.你希望这个探针注释到蛋白编码基因还是miRNA的基因呢
• 12.3种方法注释你的甲基化探针
• 13.芯片明明设计了近6万探针但是作者上传的表达矩阵仅1万多个
• 14.多个探针对应同一个基因取最大表达量探针极简代码
• 15.多个探针对应一个基因，取平均值或者最大值
• 16.多个探针对应同一个基因取最大值的代码进化历史
• 17.多个探针对应同一个基因到底该如何取舍
• 18.是人是鼠，你心里没有数？GPL21827之谜
• 19.GEO表达芯片平台 — GPL14951，注释文件探索过程
• 20.GPL平台的soft文件提供的注释信息到底准确吗
• 21.gpl16699平台的探针注释到基因名（十一月学徒投稿）
• 22.芯片的探针ID找到基因名-基于R语言-一文就够
• 23.从ensembl的ID到其转录本坐标
• 24.使用R语言获取人类所有基因的名字，ID，symbol以及别名
• 25.超精华生信ID总结，想踏入生信大门的你-值得拥有
• 26.尝试中国区的GitHub

钉钉群入群方式

本来呢，这个知识点以及后续授课的生存分析，都是属于前面的“gsea和wgcna和id转换”群，但是那个群马上就满了1000人，我们也没办法办法扩大规模，所以只能是新建一个群哈。

如果你已经在“gsea和wgcna和id转换”群，就不用重复加群了哈，我们会把直播课程同步转播在“gsea和wgcna和id转换”群里，后续 25号晚上的生存分析也是如此，多个群联播的！

“ID转换和生存分析”群的钉钉群号： 35371384，对这几个细节知识点感兴趣的可以加入，我们这个月18号(下周六晚上)八点准时授课。

另外，很多人不熟悉钉钉群加入方式，先自行搜索，不要再留言找不到群，是你自己软件操作有问题！