使用R语言完成表达芯片处理全流程视频上线

首发于生信菜鸟团博客:http://www.bio-info-trainee.com/2087.html

视频地址:https://ke.qq.com/course/286407 

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早期目录如下:

第一讲:GEO,表达芯片与R

第二讲:从GEO下载数据得到表达量矩阵

第三讲:对表达量矩阵用GSEA软件做分析

第四讲:根据分组信息做差异分析

第五讲:对差异基因结果做GO/KEGG超几何分布检验富集分析

第六讲:指定基因分组boxplot指定基因list画热图

第七讲:根据差异基因list获取string数据库的PPI网络数据

第八讲:PPI网络数据用R或者cytoscape画网络图

第九讲:网络图的子网络获取

第十讲:hug genes如何找

视频假设大家有R语言基础。

重新委托录制基础视频,并且我也给出了更新版教程

更新版目录:

解读GEO数据存放规律及下载,一文就够

解读SRA数据库规律一文就够

从GEO数据库下载得到表达矩阵 一文就够

GSEA分析一文就够(单机版+R语言版)

根据分组信息做差异分析- 这个一文不够的

差异分析得到的结果注释一文就够

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