生信技能树论坛-生信基础-医疗相关应用板块导读

本周专题是介绍生信技能树论坛的生信基础板块,本篇是其中的“医疗相关应用“子版块,会对目前此子版块中的文章进行一个汇总整理(截止2017.11.20)。

作者:冰糖

先上网址http://www.biotrainee.com/forum-103-1.html

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医疗相关应用里面的内容主要是生信与医学相关的内容,通常是比较基础的概念及应用。

你会看到很多有意思的争论视角

  1. NIH院长坦言基因筛查发现致病突变,毫无意义
  2. 不同的检测应用策略
  3. 为什么需要AI来辅助肿瘤研究呢?
  4. 癌症早筛就一定好嘛?怎么知道不会过度医疗?
  5. 我捐献给你的器官会使你得癌症
  6. 癌症很有可能被过度诊断,进而过度治疗
  7. 基因数据过多了吗?
  8. 输年轻人的血就能延缓衰老重归青春
  9. 心血管疾病才是全球的首要死因
  10. 遗传致病的冰山模型-精准理解和探究遗传致病因素:从孟德尔遗传病到遗传易感
  11. 基因突变到底是好事还是坏事?
  12. 如何处理无创DNA检测失败的孕妇
  13. 66%的癌症发生是因为运气不好

也有关于基因异常与医学表型的关系

  1. 儿童挑食的基因决定
  2. 基因使得有些人对疼痛超感,有些人无感,奇妙
  3. 自闭症有很强的遗传背景
  4. 非小细胞肺癌鳞癌应该检测哪些基因
  5. 检测基因组变异的4种策略
  6. 揭开SCN2A的神秘面纱 ———浅谈抗癫痫药物治疗效果的异…
  7. 基因检测案例分析——同病不同医
  8. 17个基因可预测AML患者的生存
  9. TP53突变VAF为MDS患者预后分层提供新依据
  10. 阿兹海默病的BDNF基因的BDNF蛋白Val66Met突变
  11. immune gene signature expression

肿瘤病理学

  1. 通过EZH2和BMI1抑制治疗胶质瘤
  2. NK细胞是癌症转移的关键控制者
  3. 所有的癌症都在随时释放细胞,为什么有些 癌症不转移呢?
  4. DIPG的H3K27M是通过H3K27ac而不是H3K27me3加重癌症的
  5. 循环肿瘤DNA可提前一年提示肺癌复发
  6. 对超一万个癌症样本只检测与癌症相关的410个基因
  7. 特异性抑制细胞周期蛋白依赖性激酶CDK4和CDK6阻断乳腺癌
  8. 关于血液病肿瘤不得不知的两个融合基因(上)
  9. 关于血液病肿瘤不得不知的两个融合基因(下)

肿瘤治疗相关

  1. 7 种癌症的 28 种靶向药物用法和不良反应
  2. 癌症基因检测小Panel检测备受青睐
  3. 将肿瘤进化作为下一个靶标 tumor evolution as a therapeutic target
  4. 肿瘤突变负荷(TMB)会是下一个bio-marker吗?
  5. 对肿瘤细胞系进行药物筛查
  6. 五种最先进的癌症治疗理念
  7. IDH突变脑瘤有希望被PARP抑制剂治疗
  8. 血液肿瘤诊断和治疗那些事儿
  9. 靶向药物和疗法能否改变传统的白血病治疗方案?
  10. 急性淋巴细胞白血病里面,重要基因的临床意义

数据库与工具

  1. 关于TCGA数据下载,我能说的就是这些了
  2. 生物信息学常见1000个软件的安装代码!
  3. 表达矩阵可视化大全
  4. 生信编程实战5个月传送门~~~
  5. 乳腺癌研究国际联盟成员
  6. 中国人群基因组突变数据库
  7. 2型糖尿病数据库资源
  8. 基因变异常用数据库一览表
  9. 美国医学遗传学与基因组学学会(ABMGG)资格认证
  10. 罕见病研究进展与实用工具全攻略
  11. 超快速的基因组分析工具SpeedSeq

测序与芯片

  1. Illumina评估癌症易感性的测序和芯片方案
  2. 全外显子组测序在癫痫疾病中的应用
  3. OncoArray基因分型平台-最大规模的乳腺癌风险相关的新基因…
  4. OncoArray基因分型平台-最大规模的全基因组肺癌易感性研究
  5. OncoArray基因分型平台

名词解释

  1. 半数致死量(median lethal dose, LD50
  2. 药物浓度-时间曲线下面积(AUC)
  3. 药物试验的IC50
  4. CNV的临床意义
  5. CNV-seq技术
  6. 肿瘤克隆演化分析是在做什么?
  7. OS、PFS、DFS 有什么区别
  8. 癌症描述stage的官方标准
  9. 肿瘤的grade和stage
  10. 你发现TCGA的样本里面并没有肿瘤grade信息,原来是因为~
  11. 血液-血浆-PBMC
  12. Liquid Biopsy VS Biopsy

癌症报告

  1. 全球癌症发病统计
  2. 美国2017癌症报告
  3. 美国社科院关于cancer的年度调查报告

其他

iPSC

  1. iPS细胞系比其它细胞系的线粒体DNA突变率要高
  2. iPSCs跟cancer cell lines and animal models.比较
  3. 肿瘤细胞反而难以重编程为iPSC

免疫治疗

  1. 免疫治疗有两个基本的途径
  2. 免疫学和免疫治疗三大问题

临床

  1. 如何写出一篇完美的临床基因检测报告?
  2. 非小细胞肺癌的大型前瞻性临床研究TRACERx

其他的其他

  1. 甲基化联合基因表达预测OSCC生存
  2. 张锋连发两篇《Nature》子刊文章 细述可能超越CRISPR-Cas9的新编辑技术
  3. 综合性液体活检公司 Guardant Health要测序100万肿瘤DNA
  4. 赛福基因公开课第二节《神经系统遗传病基因检测简介》
  5. 癌症干细胞分离培养指南
  6. 彻底搞不清楚脑胶质瘤到底该怎么分类了
  7. DIPG里面的Super-enhancers
  8. cancer按照primary site来分类并不准确
  9. 用谷歌搜索找到的自闭症相关文档
  10. OMIN数据库里面跟cancer相关的条目
  11. 胶质瘤(glioma)相关资料收集
  12. 医疗研究中的卡瑞尔(coriell)目录

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