生信菜鸟团

欢迎去论坛biotrainee.com留言参与讨论,或者关注同名微信公众号biotrainee

Main menu

Skip to primary content
Skip to secondary content
  • 首页
  • 计算机基础
    • R
    • perl
    • linux
  • 生信基础
    • 基础数据库
    • 基础数据格式
    • 基础软件
  • 杂谈-随笔
  • 生信组学技术
    • 全外显子组软件
    • 基因组学
    • 转录组软件
    • 进化专题

Tag Archives: 原始数据

三 19

SRA工具sratoolkit把原始测序数据转为fastq格式

Posted on 2015年3月19日 by ulwvfje

一,下载该软件

wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz

tar xzf sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz

解压直接使用即可,里面有一大堆的软件,针对不同的测序仪,不同的数据 Continue reading →

Posted in linux, 基础数据库, 基础软件 | Tagged reads, shell, sratoolkit, 原始数据

标签

annovar bioconductor bowtie bwt CHIP-seq ENSEMBL GEO GSEA limma linux miRNA-seq mutation mysql ncbi Peak perl R RNA-seq samtools shell snp SRA TCGA UCSC vcf 包 变异 可视化 基因组 差异分析 差异基因 数据库 文献 服务器 模块 比对 注释 癌症 直播 突变 脚本 芯片 转录组 转载 遗传咨询

分类目录

  • cancer (88)
  • tutorial (35)
  • 备忘录 (1)
  • 未分类 (1,838)
  • 杂谈-随笔 (58)
  • 生信基础 (193)
    • 基础数据库 (77)
    • 基础数据格式 (16)
    • 基础软件 (73)
  • 生信组学技术 (67)
    • CHIP-seq (13)
    • 免疫组库 (1)
    • 全外显子组软件 (7)
    • 基因组学 (8)
    • 芯片数据处理 (2)
    • 转录组软件 (31)
    • 进化专题 (3)
  • 直播我的个人基因组 (24)
  • 计算机基础 (132)
    • linux (31)
    • perl (34)
    • R (78)

近期评论

  • GJ发表在《关于我》
  • 大熊发表在《关于我》
  • ulwvfje发表在《关于我》
  • 来巡山发表在《关于我》
  • 来巡山发表在《关于我》
  • 基因组学
  • 转录组软件
  • 全外显子组软件
2025年5月
一 二 三 四 五 六 日
« 九    
 1234
567891011
12131415161718
19202122232425
262728293031  
© 2025 生信菜鸟团
粤ICP备15016384号

Admired Theme