NGS流程层出不穷，哪怕是以我持续7年累积写作1.3万篇教程的高产来说，也没办法囊括全部的知识点。但是只需要学到了我的知识整理方法，对一个入门级别工程师来说，摸索新流程其实并不难！这里，我们以CUT&Tag 数据处理为例子，因为今早起来我在朋友圈看到了“二货潜”的分享，非常认真的一个小伙伴，他给CUT&Tag 数据处理写了一个手把手教程，没有遇到应有的读者，值得大力推荐： Continue reading →

翻译自：https://constantamateur.github.io/2020-10-24-scBatch2/
更多教程见其博客：https://constantamateur.github.io/ Continue reading →

前面我们已经完成了cytof数据处理的主要步骤，读入文件，质量控制，降维聚类分群，生物学注释和细胞亚群比例差异分析。 目录如下： Continue reading →

前面我们展现了 CNS图表复现08—肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则，然后呢，第二次分群的上皮细胞可以细分恶性与否，免疫细胞呢，细分可以成为: B细胞，T细胞，巨噬细胞，树突细胞等等。实际上每个免疫细胞亚群仍然可以继续精细的划分，以文章为例： Continue reading →

翻译自：https://constantamateur.github.io/2020-10-24-scBatch2/

更多教程见其博客： https://constantamateur.github.io/2020-04-10-scDE/

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我注意到绝大部分肿瘤相关的单细胞转录组研究的落脚点都是在肿瘤免疫微环境个细胞亚群比例，包括 B细胞，T细胞，巨噬细胞，树突细胞等等，而且这些细胞亚群都是可以继续细分。但实际上在没有单细胞转录组数据这个技术之前，也是可以探测肿瘤免疫微环境个细胞亚群比例的，比如流式细胞仪。但是我查了一下，发现这个仪器还蛮贵的，比如一个招标信息《上海交通大学流式细胞分选仪，200万》： Continue reading →

众所周知，测序数据单端测序就是一个fq文件，双端测序就2个。但是呢，10X的单细胞转录组原始数据的话， 比较特殊，它的测序文库中包括index、barcode、UMI和测序reads。 Continue reading →

前面我们公布了《cytof数据资源介绍（文末有交流群）》，现在就开始正式手把手教学。

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前面我们公布了《cytof数据资源介绍（文末有交流群）》，现在就开始正式手把手教学。

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